43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0302 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0316  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  100 
 
 		 95 aa  191  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0302  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  100 
 
 		 95 aa  191  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0525358  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2163  50S ribosomal protein L30e  58.95 
 
 		 96 aa  120  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0171744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0054  50S ribosomal protein L30e  57.89 
 
 		 95 aa  114  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0738724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1930  50S ribosomal protein L30e  54.17 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0294284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0372  50S ribosomal protein L30E  49.46 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3690  50S ribosomal protein L30e  48.91 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.248042 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0031  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  43.62 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0283  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  44.33 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0787  50S ribosomal protein L30e  46.32 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1175  50S ribosomal protein L30e  37.63 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000129026  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0213  50S ribosomal protein L30e  42.11 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2324  50S ribosomal protein L30e  39.36 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00112363  decreased coverage  0.00000131397 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1308  50S ribosomal protein L30e  40 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0675  50S ribosomal protein L30e  42.11 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0610  50S ribosomal protein L30e  40 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1088  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.56 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.342789  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2094  50S ribosomal protein L30e  36.17 
 
 		 101 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1966  50S ribosomal protein L30e  36.17 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000000573809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0700  50S ribosomal protein L30e  37.23 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0156911  normal  0.0492944 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06082  60S ribosomal protein L30, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09200)  38.37 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1201  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.29 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30944  predicted protein  35.79 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.212607  normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37627  Ribosomal protein L30, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.98 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167554  normal  0.0307428 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0320  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.02 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259957  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43840  predicted protein  32.98 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.881392  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.78 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0036  50S ribosomal protein L30e  35.05 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000178932  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02220  60s ribosomal protein l30-1 (l32), putative  32.26 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0493078  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  35.87 
 
 		 125 aa  52  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1846  50S ribosomal protein L7Ae  40.22 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  37.5 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  37.5 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  35.23 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  38.37 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  38.37 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  37.21 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2775  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.75 
 
 		 115 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000786101  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0806  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.33 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000124413  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0352  50S ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  25.81 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1665  50S ribosomal protein L7Ae  35.8 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0339872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0248  50S ribosomal protein L7Ae  35.8 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0963  50S ribosomal protein L7Ae  35.8 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>