21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0352 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0352  50S ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  100 
 
 		 107 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1201  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.99 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3690  50S ribosomal protein L30e  28.57 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.248042 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1175  50S ribosomal protein L30e  28.42 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000129026  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0787  50S ribosomal protein L30e  29.47 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0283  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  28.57 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37627  Ribosomal protein L30, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  31.71 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167554  normal  0.0307428 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30944  predicted protein  32.93 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.212607  normal  0.515447 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06082  60S ribosomal protein L30, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09200)  28.57 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0213  50S ribosomal protein L30e  27.16 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0675  50S ribosomal protein L30e  28.4 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0610  50S ribosomal protein L30e  25.93 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0320  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  24.47 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259957  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1308  50S ribosomal protein L30e  25.93 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1930  50S ribosomal protein L30e  27.66 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0294284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0372  50S ribosomal protein L30E  28.57 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0036  50S ribosomal protein L30e  25.27 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000178932  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0054  50S ribosomal protein L30e  27.27 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0738724 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02220  60s ribosomal protein l30-1 (l32), putative  30.77 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0493078  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0302  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  25.81 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0525358  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0316  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  25.81 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>