40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0320 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0320  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  100 
 
 		 103 aa  207  4e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259957  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2094  50S ribosomal protein L30e  54.64 
 
 		 101 aa  115  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0700  50S ribosomal protein L30e  54.64 
 
 		 101 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0156911  normal  0.0492944 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1966  50S ribosomal protein L30e  53.61 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000000573809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2324  50S ribosomal protein L30e  50.52 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00112363  decreased coverage  0.00000131397 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0283  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.38 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0675  50S ribosomal protein L30e  36.46 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06082  60S ribosomal protein L30, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09200)  39.78 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0610  50S ribosomal protein L30e  35.42 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0213  50S ribosomal protein L30e  35.42 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1308  50S ribosomal protein L30e  35.42 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0787  50S ribosomal protein L30e  34.38 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37627  Ribosomal protein L30, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.96 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167554  normal  0.0307428 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1201  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.26 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02220  60s ribosomal protein l30-1 (l32), putative  34.78 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0493078  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0036  50S ribosomal protein L30e  36.36 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000178932  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0031  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.11 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1175  50S ribosomal protein L30e  37.5 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000129026  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30944  predicted protein  32.98 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.212607  normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3690  50S ribosomal protein L30e  35.79 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.248042 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1088  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.68 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.342789  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43840  predicted protein  32.26 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.881392  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0372  50S ribosomal protein L30E  36.46 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1930  50S ribosomal protein L30e  33.33 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0294284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0302  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.02 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0525358  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0316  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.02 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275306  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2163  50S ribosomal protein L30e  31.25 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0171744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0054  50S ribosomal protein L30e  28.87 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0738724 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1663  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  39.44 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000334111  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0352  50S ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  24.47 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0331  50S ribosomal protein L7Ae  34.12 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  32.63 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3388  50S ribosomal protein L7Ae  30.34 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.48 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  29.89 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  29.89 
 
 		 151 aa  42  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  32.18 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  28.74 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.63 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  31.76 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>