45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0925 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0925  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  100 
 
 		 105 aa  205  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00222099  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1663  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  54.64 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000334111  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3189  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.24 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000958569  normal  0.145254 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0835  30S ribosomal protein L7Ae, putative  33.68 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1958  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.38 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.268477  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0456  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.31 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2046  hypothetical protein  38.3 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3677  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  30.21 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701779  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1049  50S ribosomal protein L7AE  36.67 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677595  unclonable  0.0000000101124 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2775  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.42 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000786101  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0816  hypothetical protein  31.63 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.560266  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1154  hypothetical protein  33.7 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0992  50S ribosomal protein L7AE  32.67 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143907  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1354  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  29.59 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1332  hypothetical protein  29.13 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000143752  hitchhiker  0.0000753067 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1328  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  29.59 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2466  hypothetical protein  28.87 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000938075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3636  hypothetical protein  28.16 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00050077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3912  hypothetical protein  29.13 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0236889  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3555  hypothetical protein  29.13 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3861  hypothetical protein  29.13 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3951  hypothetical protein  29.13 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00360527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3826  hypothetical protein  29.13 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.46605e-63 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3665  hypothetical protein  29.13 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000505852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3852  hypothetical protein  29.13 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0106157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3573  hypothetical protein  29.13 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00318264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0154  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.63 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0152  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.71 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172109  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1646  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  28.57 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0039527  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1941  ribosomal protein L7Ae family protein  22.34 
 
 		 100 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1659  ribosomal protein L7Ae family protein  22.34 
 
 		 100 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0698  50S ribosomal protein L7AE  29.17 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000137863  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0382  hypothetical protein  30.11 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.724071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  31.25 
 
 		 200 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0571  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.61 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0989757  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0380  hypothetical protein  28.12 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0621  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  27.17 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000359696  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0813  ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a)  28.75 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0074581  hitchhiker  0.00762909 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  32 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1443  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  28.87 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00290557  normal  0.16592 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  29.9 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  30.49 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  30.49 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3728  50S ribosomal protein L7AE  32.61 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.058823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  35.35 
 
 		 212 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>