50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0992 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0992  50S ribosomal protein L7AE  100 
 
 		 117 aa  227  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143907  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0456  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  51.82 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2775  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  51.61 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000786101  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1154  hypothetical protein  44 
 
 		 100 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3636  hypothetical protein  46.24 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00050077  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3951  hypothetical protein  45.16 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00360527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3861  hypothetical protein  45.16 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3912  hypothetical protein  45.16 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0236889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3826  hypothetical protein  45.16 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.46605e-63 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3573  hypothetical protein  45.16 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00318264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3555  hypothetical protein  45.16 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3665  hypothetical protein  45.16 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000505852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3852  hypothetical protein  45.16 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0106157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1332  hypothetical protein  44.09 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000143752  hitchhiker  0.0000753067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2466  hypothetical protein  43.48 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000938075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2046  hypothetical protein  40.2 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0835  30S ribosomal protein L7Ae, putative  40.59 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1646  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  41.75 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0039527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1328  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  42.86 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1354  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  42.86 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3677  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  43.88 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701779  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1443  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.34 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00290557  normal  0.16592 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0382  hypothetical protein  36.46 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.724071  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1049  50S ribosomal protein L7AE  37.78 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677595  unclonable  0.0000000101124 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0816  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.560266  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0925  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.67 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00222099  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0813  ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a)  36.27 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0074581  hitchhiker  0.00762909 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1958  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.03 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.268477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  38.14 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  38.14 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1663  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.63 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000334111  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  35.29 
 
 		 203 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0380  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0698  50S ribosomal protein L7AE  30.69 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000137863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  33.33 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0571  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.46 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0989757  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1941  ribosomal protein L7Ae family protein  34.04 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1659  ribosomal protein L7Ae family protein  34.04 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0432  50S ribosomal protein L7AE  33.33 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.899191  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0152  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.52 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172109  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0154  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.56 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931846  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  31.68 
 
 		 200 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0334  ribosomal protein L7A family protein  32.63 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3189  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.99 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000958569  normal  0.145254 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  35.48 
 
 		 197 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  27.27 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  31.96 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3780  hypothetical protein  36.54 
 
 		 263 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0224  hypothetical protein  32.05 
 
 		 246 aa  40  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0530  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.58 
 
 		 112 aa  40  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>