80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2069 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  417  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3780  hypothetical protein  49.48 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  42.71 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  42.71 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0224  hypothetical protein  46.6 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1164  hypothetical protein  40.89 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2756  hypothetical protein  41.92 
 
 		 202 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.014789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2825  hypothetical protein  40.31 
 
 		 202 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  39.58 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  42.35 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  42.93 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  42.93 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  39.89 
 
 		 234 aa  121  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  39.67 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0032  hypothetical protein  35.14 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  41.71 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  43.02 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  40.83 
 
 		 257 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  40.57 
 
 		 249 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3627  hypothetical protein  39.15 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0056  hypothetical protein  35.32 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  35.63 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  37.04 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  32.54 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3929  hypothetical protein  37.32 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336833  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  35.8 
 
 		 200 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  35.29 
 
 		 246 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_004310  BR2164  hypothetical protein  35.8 
 
 		 200 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2076  hypothetical protein  35.23 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0599  hypothetical protein  34.83 
 
 		 275 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0023  hypothetical protein  34.38 
 
 		 221 aa  95.1  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  0.0323771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0479  hypothetical protein  35.36 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0168  hypothetical protein  33.84 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  28.88 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  34.48 
 
 		 264 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0441  hypothetical protein  33.67 
 
 		 259 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  32.97 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  29.33 
 
 		 230 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  86.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0030  hypothetical protein  30.69 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2491  hypothetical protein  30 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00369583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  31.06 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  31.06 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  35 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3728  50S ribosomal protein L7AE  30.95 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.058823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  30.69 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  30.43 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  36.43 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  33.51 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  34.78 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  35.96 
 
 		 139 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1060  hypothetical protein  35.64 
 
 		 97 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0185112  normal  0.0579872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.35 
 
 		 130 aa  44.7  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  28.36 
 
 		 90 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  30 
 
 		 104 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  34.83 
 
 		 119 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  28.36 
 
 		 90 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  40.96 
 
 		 524 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0992  50S ribosomal protein L7AE  27.27 
 
 		 117 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143907  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  37.63 
 
 		 113 aa  43.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3677  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.21 
 
 		 98 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701779  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2775  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  30.26 
 
 		 115 aa  42.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000786101  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  25.35 
 
 		 93 aa  42.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  25.37 
 
 		 90 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0777  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  34.78 
 
 		 93 aa  42  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.894427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  25.37 
 
 		 93 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  28.69 
 
 		 151 aa  42  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  25.37 
 
 		 90 aa  42  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  25.37 
 
 		 93 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  25.37 
 
 		 93 aa  42  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4040  hypothetical protein  35.92 
 
 		 120 aa  42  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0434499  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  25.37 
 
 		 90 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  25.37 
 
 		 90 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  25.37 
 
 		 90 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1181  hypothetical protein  34.21 
 
 		 135 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0245041  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2064  hypothetical protein  36.14 
 
 		 147 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  37.93 
 
 		 79 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2127  hypothetical protein  36.14 
 
 		 124 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144756  decreased coverage  0.00998453 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  27.5 
 
 		 96 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2081  hypothetical protein  36.14 
 
 		 124 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>