52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1154 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1154  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  201  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510344  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2046  hypothetical protein  73 
 
 		 102 aa  150  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3852  hypothetical protein  70.53 
 
 		 103 aa  141  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0106157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3665  hypothetical protein  70.53 
 
 		 103 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000505852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3555  hypothetical protein  70.53 
 
 		 103 aa  141  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3573  hypothetical protein  70.53 
 
 		 103 aa  141  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00318264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3826  hypothetical protein  70.53 
 
 		 103 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.46605e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3951  hypothetical protein  70.53 
 
 		 103 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00360527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3912  hypothetical protein  70.53 
 
 		 103 aa  141  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0236889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3861  hypothetical protein  70.53 
 
 		 103 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1332  hypothetical protein  69.47 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000143752  hitchhiker  0.0000753067 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3636  hypothetical protein  69.47 
 
 		 103 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00050077  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2466  hypothetical protein  68.42 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000938075  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1354  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  55 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1328  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  55 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0835  30S ribosomal protein L7Ae, putative  50 
 
 		 105 aa  100  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0816  hypothetical protein  44.79 
 
 		 101 aa  90.1  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.560266  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0456  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  44.33 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0382  hypothetical protein  44.79 
 
 		 100 aa  87.4  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.724071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0992  50S ribosomal protein L7AE  44 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143907  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0698  50S ribosomal protein L7AE  47.87 
 
 		 103 aa  84.7  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000137863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2775  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  45.83 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000786101  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0380  hypothetical protein  40.22 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1646  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  40.62 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0039527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1443  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.35 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00290557  normal  0.16592 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3189  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  43.82 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000958569  normal  0.145254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3677  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  43.01 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701779  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1663  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.44 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000334111  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0925  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.7 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00222099  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  37.37 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  35.35 
 
 		 205 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1049  50S ribosomal protein L7AE  40.45 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677595  unclonable  0.0000000101124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1958  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.87 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.268477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  34.78 
 
 		 197 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  34.69 
 
 		 205 aa  52  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  30.11 
 
 		 197 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  30.11 
 
 		 197 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1659  ribosomal protein L7Ae family protein  26.6 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1941  ribosomal protein L7Ae family protein  26.6 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3780  hypothetical protein  31.18 
 
 		 263 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0154  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.18 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931846  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  30 
 
 		 203 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  36.25 
 
 		 212 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0219  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.14 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000001803  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0530  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  26 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  33.71 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0813  ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a)  30.11 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0074581  hitchhiker  0.00762909 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0256  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  26 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.405727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01110  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.06 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000450722  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0152  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.75 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172109  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  32.99 
 
 		 252 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0188  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  27.4 
 
 		 82 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158603  decreased coverage  0.00101223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>