50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1354 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1328  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  100 
 
 		 105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1354  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  100 
 
 		 105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0835  30S ribosomal protein L7Ae, putative  67.62 
 
 		 105 aa  148  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1154  hypothetical protein  55 
 
 		 100 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510344  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2466  hypothetical protein  51.04 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000938075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3852  hypothetical protein  51.55 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0106157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3665  hypothetical protein  51.55 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000505852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3555  hypothetical protein  51.55 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3573  hypothetical protein  51.55 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00318264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3861  hypothetical protein  51.55 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3951  hypothetical protein  51.55 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00360527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3912  hypothetical protein  51.55 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0236889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3826  hypothetical protein  51.55 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.46605e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1332  hypothetical protein  50.52 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000143752  hitchhiker  0.0000753067 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3636  hypothetical protein  49.48 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00050077  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2046  hypothetical protein  47 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0816  hypothetical protein  39.58 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.560266  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0382  hypothetical protein  39.18 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.724071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1443  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.78 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00290557  normal  0.16592 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2775  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.14 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000786101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0992  50S ribosomal protein L7AE  42.86 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143907  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0698  50S ribosomal protein L7AE  39.8 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000137863  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0380  hypothetical protein  38.54 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0456  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.71 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1659  ribosomal protein L7Ae family protein  35.79 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1941  ribosomal protein L7Ae family protein  35.79 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1663  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.11 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000334111  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1049  50S ribosomal protein L7AE  38.89 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677595  unclonable  0.0000000101124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3677  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  40.43 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1958  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.84 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.268477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  30 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0925  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  29.59 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00222099  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0432  50S ribosomal protein L7AE  33.33 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.899191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  31.37 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  29 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1356  50S ribosomal protein L7AE  33.66 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1646  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.67 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0039527  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0813  ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a)  35.05 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0074581  hitchhiker  0.00762909 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  30 
 
 		 205 aa  48.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3189  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  28.72 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000958569  normal  0.145254 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  29.41 
 
 		 212 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl294  ribosomal protein L7A family protein  30.85 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116667  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  28.57 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0154  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  27.08 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931846  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0621  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  28.87 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000359696  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06082  60S ribosomal protein L30, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09200)  34.88 
 
 		 106 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  27 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  25.93 
 
 		 252 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3728  50S ribosomal protein L7AE  27.84 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.058823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  26 
 
 		 197 aa  40  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>