26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl294 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl294  ribosomal protein L7A family protein  100 
 
 
99 aa  192  1e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116667  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0334  ribosomal protein L7A family protein  61.62 
 
 
99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0698  50S ribosomal protein L7AE  42.68 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000137863  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0382  hypothetical protein  40.26 
 
 
100 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.724071  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1356  50S ribosomal protein L7AE  41.89 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0380  hypothetical protein  36.05 
 
 
100 aa  52  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0835  30S ribosomal protein L7Ae, putative  33.71 
 
 
105 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0816  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.560266  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2046  hypothetical protein  31.75 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1659  ribosomal protein L7Ae family protein  32.95 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1941  ribosomal protein L7Ae family protein  32.95 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2466  hypothetical protein  32.97 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000938075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1332  hypothetical protein  31.87 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000143752  hitchhiker  0.0000753067 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3636  hypothetical protein  34.07 
 
 
103 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00050077  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3852  hypothetical protein  30.77 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0106157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3826  hypothetical protein  30.77 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.46605e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3912  hypothetical protein  30.77 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0236889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3861  hypothetical protein  30.77 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0530  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.63 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3665  hypothetical protein  30.77 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000505852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3555  hypothetical protein  30.77 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3573  hypothetical protein  30.77 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00318264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3951  hypothetical protein  30.77 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00360527  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0621  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  29.47 
 
 
120 aa  45.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000359696  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1354  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  30.85 
 
 
105 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1328  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  30.85 
 
 
105 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>