23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_8686 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_8686  predicted protein  100 
 
 		 116 aa  229  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12596  Ribosomal protein S12, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  49.54 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.727796  normal  0.5347 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03760  40S ribosomal protein S12, putative  48.18 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04073  40S ribosomal protein S12 (Broad)  39.86 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.713259  normal  0.323926 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91009  predicted protein  41.07 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.68 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0219  50S ribosomal protein L7Ae  39.68 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  34.29 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  33.68 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3388  50S ribosomal protein L7Ae  36.51 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0523  50S ribosomal protein L7Ae  33.33 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1497  50S ribosomal protein L7Ae  36.51 
 
 		 122 aa  43.5  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.122049 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  30.53 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  30.68 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0721  50S ribosomal protein L7Ae  31.75 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0318706  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0331  50S ribosomal protein L7Ae  32.81 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  32.79 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0225  50S ribosomal protein L7Ae  31.34 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  28.57 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  28.87 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0690  50S ribosomal protein L7Ae  31.75 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.197581 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  29.47 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1601  50S ribosomal protein L7Ae  31.25 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.718255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>