45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0209 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0209  ribosomal protein L7ae family protein  100 
 
 		 83 aa  169  9e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343834  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0219  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  48.19 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000001803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1530  hypothetical protein  52.44 
 
 		 83 aa  84  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0280  putative ribosomal protein L7Ae-like protein  50.63 
 
 		 82 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000500453  decreased coverage  0.00000955735 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2726  50S ribosomal protein L7AE  53.85 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000168835  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2466  50S ribosomal protein L7AE  45.78 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0416  ribosomal protein L7AE family protein  50.65 
 
 		 83 aa  77  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000181498  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2717  hypothetical protein  43.9 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.133406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0105  putative ribosomal protein L7Ae-like  41.25 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000154657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0098  hypothetical protein  38.75 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000338227  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0314  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  44.29 
 
 		 80 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0101  putative ribosomal protein L7Ae-like  41.25 
 
 		 82 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0188  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  41.46 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158603  decreased coverage  0.00101223 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0135  hypothetical protein  36.25 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000655713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0116  hypothetical protein  36.25 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.74724e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5201  hypothetical protein  36.25 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000267841  unclonable  7.36265e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0099  hypothetical protein  36.25 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0104  hypothetical protein  36.25 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0098  hypothetical protein  36.25 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0100  hypothetical protein  36.25 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000444841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0104  hypothetical protein  36.25 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000573275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0104  hypothetical protein  36.25 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000288714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0125  hypothetical protein  36.25 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0806  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  41.25 
 
 		 84 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000124413  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0861  putative L7Ae-like ribosomal protein  44.93 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000301408  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01110  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.5 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000450722  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2339  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.5 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000362211  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.82 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.65 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0219  50S ribosomal protein L7Ae  36.47 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2406  ribosomal protein L7AE family protein  34.72 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000118333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2720  ribosomal protein L7AE family protein  34.72 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000573483  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  36.78 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0721  50S ribosomal protein L7Ae  35.71 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0318706  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  36.47 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  36.47 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0331  50S ribosomal protein L7Ae  37.65 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1601  50S ribosomal protein L7Ae  32.53 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.718255 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  40.58 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1497  50S ribosomal protein L7Ae  34.52 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.122049 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  34.12 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  38.81 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  35.29 
 
 		 169 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0185  putative ribosomal protein L7Ae-like  30.77 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000360647  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0690  50S ribosomal protein L7Ae  33.73 
 
 		 122 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.197581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>