More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28358 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_28358  RNA pol II transcription cofactor  100 
 
 
339 aa  699    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.155514 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01460  pirin, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04510)  50.67 
 
 
310 aa  311  7.999999999999999e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.7122 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01780  conserved hypothetical protein  39.94 
 
 
337 aa  232  5e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293563  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  39.93 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  38.78 
 
 
292 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  37.29 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  37.33 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  39.12 
 
 
292 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  36.99 
 
 
290 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  36.64 
 
 
290 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  37.33 
 
 
290 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  36.64 
 
 
290 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  36.64 
 
 
290 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  36.64 
 
 
290 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  38.23 
 
 
298 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  36.33 
 
 
337 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  35.25 
 
 
337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  36.33 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  36.33 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  37.2 
 
 
298 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  38.03 
 
 
285 aa  179  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  37.76 
 
 
310 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  34.92 
 
 
290 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  34.92 
 
 
290 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  34.92 
 
 
290 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  34.25 
 
 
290 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  34.25 
 
 
290 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  34.25 
 
 
290 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  36.9 
 
 
298 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  36.49 
 
 
307 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  36.14 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  38.3 
 
 
289 aa  172  6.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  36.14 
 
 
294 aa  172  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  36.65 
 
 
286 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  36.65 
 
 
286 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  36.84 
 
 
286 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  34.26 
 
 
294 aa  170  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  36.3 
 
 
279 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  34.27 
 
 
304 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  33.33 
 
 
293 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  37.01 
 
 
285 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  33.11 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  33.91 
 
 
299 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  35.69 
 
 
277 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  32.99 
 
 
331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  36.36 
 
 
283 aa  164  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  34.44 
 
 
302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  36.97 
 
 
285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  33.91 
 
 
284 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  34.67 
 
 
279 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  32.89 
 
 
290 aa  159  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  33.77 
 
 
302 aa  159  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  32.54 
 
 
320 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  34.47 
 
 
285 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  34.86 
 
 
299 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  34.38 
 
 
284 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  33.67 
 
 
300 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  33 
 
 
309 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  35.02 
 
 
306 aa  157  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  33.21 
 
 
286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  32.36 
 
 
302 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00280  Pirin-related protein  30.77 
 
 
342 aa  156  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  32.28 
 
 
346 aa  155  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  36.1 
 
 
288 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  33.33 
 
 
309 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  32.07 
 
 
315 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  32.74 
 
 
287 aa  152  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  33.68 
 
 
301 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  35.07 
 
 
303 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  34.11 
 
 
303 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  33.9 
 
 
284 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  34.41 
 
 
288 aa  149  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  34.62 
 
 
283 aa  149  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2491  Pirin domain protein  36.47 
 
 
277 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  32.76 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  34.24 
 
 
303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  33.33 
 
 
284 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  33.11 
 
 
286 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  33.22 
 
 
312 aa  146  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  33.92 
 
 
274 aa  146  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  34.14 
 
 
289 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  32.82 
 
 
293 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  33.11 
 
 
302 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  31.05 
 
 
328 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  33.92 
 
 
282 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  30.66 
 
 
283 aa  143  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  32.65 
 
 
280 aa  143  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  33.98 
 
 
287 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  35.15 
 
 
303 aa  143  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  34.03 
 
 
282 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  33.33 
 
 
303 aa  142  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  31.38 
 
 
322 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  30.38 
 
 
324 aa  142  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  33.46 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  31.96 
 
 
323 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  33.46 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  33.46 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  31.76 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  35.36 
 
 
299 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  35.05 
 
 
282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>