More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1112 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1112  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0994  riboflavin synthase subunit alpha  97.25 
 
 		 190 aa  360  5.0000000000000005e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1416  riboflavin synthase subunit alpha  49.41 
 
 		 197 aa  186  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0044  riboflavin synthase subunit alpha  53.37 
 
 		 188 aa  180  8.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  45.25 
 
 		 209 aa  138  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  45.34 
 
 		 207 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1416  riboflavin synthase subunit alpha  45.24 
 
 		 219 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  45.22 
 
 		 213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  41.94 
 
 		 199 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  44.94 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  42.68 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  41.4 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  45.62 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  43.4 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04961  riboflavin synthase subunit alpha  42.33 
 
 		 217 aa  128  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.184408 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1773  riboflavin synthase subunit alpha  42.33 
 
 		 217 aa  127  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0488322  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  36.61 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  41.86 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  39.55 
 
 		 239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  45.68 
 
 		 217 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  44.94 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  46.25 
 
 		 202 aa  124  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  43.79 
 
 		 215 aa  124  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  42.6 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  44.31 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 		 199 aa  123  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  41.4 
 
 		 217 aa  123  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0130  riboflavin synthase subunit alpha  38.07 
 
 		 198 aa  122  2e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0226834  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  42.77 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2762  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 225 aa  122  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  41.98 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3288  riboflavin synthase subunit alpha  40.37 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211802 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1617  riboflavin synthase subunit alpha  41.88 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2569  riboflavin synthase subunit alpha  41.86 
 
 		 241 aa  122  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  43.71 
 
 		 219 aa  121  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  41.77 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  40.62 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  41.76 
 
 		 214 aa  121  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  42.6 
 
 		 221 aa  121  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  40.56 
 
 		 220 aa  121  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  43.31 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0733  riboflavin synthase subunit alpha  38.18 
 
 		 200 aa  120  8e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  41.36 
 
 		 197 aa  120  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  43.03 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  41.67 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  44.87 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  44.94 
 
 		 222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  41.32 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  44.3 
 
 		 227 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2131  riboflavin synthase subunit alpha  39.33 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  39.77 
 
 		 229 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0879  riboflavin synthase subunit alpha  39.67 
 
 		 200 aa  118  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888006  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  40.91 
 
 		 196 aa  118  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  42.68 
 
 		 216 aa  118  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  41.32 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  39.77 
 
 		 229 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  39.52 
 
 		 218 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 221 aa  118  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  36.07 
 
 		 217 aa  117  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  45.18 
 
 		 207 aa  117  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  40.66 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0243  riboflavin synthase subunit alpha  40.94 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  41.77 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  40.24 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  40.24 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  43.04 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  37.13 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  41.07 
 
 		 223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  42.26 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  39.87 
 
 		 196 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  40.98 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1930  riboflavin synthase subunit alpha  36.05 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0853  riboflavin synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 220 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  41.25 
 
 		 223 aa  115  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  43.04 
 
 		 219 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  43.67 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  39.13 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  45.45 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  42.24 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  41.77 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  43.67 
 
 		 218 aa  114  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  41.77 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  43.67 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  43.67 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04391  riboflavin synthase subunit alpha  40.49 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  43.67 
 
 		 218 aa  114  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 192 aa  114  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  42.77 
 
 		 219 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 216 aa  114  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  42.41 
 
 		 220 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  42.77 
 
 		 219 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  43.67 
 
 		 218 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  42.33 
 
 		 211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  40.23 
 
 		 193 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  43.67 
 
 		 218 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  38.37 
 
 		 214 aa  114  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  43.67 
 
 		 218 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>