More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0994 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0994  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 190 aa  384  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1112  riboflavin synthase subunit alpha  97.25 
 
 		 182 aa  360  6e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1416  riboflavin synthase subunit alpha  48.69 
 
 		 197 aa  204  9e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0044  riboflavin synthase subunit alpha  51.41 
 
 		 188 aa  188  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  44.62 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  42.5 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  41.62 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  36.59 
 
 		 219 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  41.45 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1416  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 219 aa  133  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  39.79 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  40.53 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  38.97 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  36.5 
 
 		 210 aa  131  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04961  riboflavin synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 217 aa  131  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.184408 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1773  riboflavin synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0488322  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  38.78 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  37.32 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  43.4 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  39 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  45.62 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  42.56 
 
 		 202 aa  128  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  42.71 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  38.95 
 
 		 217 aa  128  6e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  43.68 
 
 		 217 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04391  riboflavin synthase subunit alpha  38.54 
 
 		 221 aa  127  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 205 aa  127  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3288  riboflavin synthase subunit alpha  38.14 
 
 		 194 aa  127  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  44 
 
 		 221 aa  127  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  42.41 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  37.11 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  41.49 
 
 		 206 aa  125  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1617  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  38.86 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2762  riboflavin synthase subunit alpha  39.2 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  37.56 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2569  riboflavin synthase subunit alpha  38.16 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  40.41 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  39.79 
 
 		 221 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  40.8 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 208 aa  124  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  39.79 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0853  riboflavin synthase subunit alpha  39.5 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  40.49 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  40.1 
 
 		 197 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  37.2 
 
 		 229 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  37.2 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2131  riboflavin synthase subunit alpha  38.66 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0733  riboflavin synthase subunit alpha  36.04 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  40.3 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  36.76 
 
 		 218 aa  121  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  39.49 
 
 		 220 aa  121  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  39.89 
 
 		 220 aa  121  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  39.47 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  36.08 
 
 		 217 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0879  riboflavin synthase subunit alpha  39.2 
 
 		 200 aa  120  9e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  39.9 
 
 		 216 aa  120  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0130  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0226834  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1930  riboflavin synthase subunit alpha  34.03 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0441  riboflavin synthase subunit alpha  34.54 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0861062  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  40 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  38.34 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  39.69 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4388  riboflavin synthase, alpha subunit  40.74 
 
 		 222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  39.69 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2883  riboflavin synthase subunit alpha  39.22 
 
 		 215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.34702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  41.03 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  37.63 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  41.5 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  40.5 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  37.23 
 
 		 196 aa  118  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  40.62 
 
 		 219 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  39.2 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  40.1 
 
 		 223 aa  118  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  39.39 
 
 		 202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  39.15 
 
 		 215 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  40.62 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  37.86 
 
 		 214 aa  118  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 		 192 aa  118  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  39.69 
 
 		 193 aa  118  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  39.49 
 
 		 219 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 219 aa  117  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  39.36 
 
 		 216 aa  117  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0301  riboflavin synthase subunit alpha  37.09 
 
 		 214 aa  117  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  38.02 
 
 		 216 aa  117  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 218 aa  117  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 218 aa  117  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>