More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3600 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.899503  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13563  short chain dehydrogenase  57.47 
 
 		 260 aa  293  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000268632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1530  short chain dehydrogenase  56.81 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5228  short chain dehydrogenase  56.42 
 
 		 261 aa  285  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.940368  normal  0.168178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4646  short chain dehydrogenase  58.37 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5029  short chain dehydrogenase  58.37 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.30549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4734  short chain dehydrogenase  58.37 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.332046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.49 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2636  short chain dehydrogenase  51.56 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.842689  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.44 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00507501  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2833  short chain dehydrogenase  51.56 
 
 		 258 aa  214  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4372  short chain dehydrogenase  44.92 
 
 		 279 aa  192  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 259 aa  148  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5492  short chain dehydrogenase  38.7 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 		 259 aa  142  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.670645 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1534  short chain dehydrogenase  35 
 
 		 263 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0157122  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0928  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8773  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 		 261 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.18 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.68 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 		 250 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 		 254 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 		 254 aa  111  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000362562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1682  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.99 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.72 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 		 263 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 		 263 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.526746 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 		 263 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0533627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3955  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4563  short chain dehydrogenase  32.58 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00447639  hitchhiker  0.00143466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.12 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.17 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5385  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  31.68 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4098  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.474708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4169  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.24 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.31 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.73 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 		 250 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6250  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1607  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.08 
 
 		 248 aa  102  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000319104  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0890906  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0936  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  28.95 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.664798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1089  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.41 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  29.23 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.6 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  28.2 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.35 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1906  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.8 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000158661  hitchhiker  0.0000072353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450975 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1785  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.15 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.136099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0732  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3959  short chain dehydrogenase  30.89 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3832  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.919217  normal  0.496442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>