More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2636 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2636  short chain dehydrogenase  100 
 
 
258 aa  512  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.842689  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2833  short chain dehydrogenase  91.47 
 
 
258 aa  438  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.34 
 
 
258 aa  330  9e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00507501  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.91 
 
 
260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13563  short chain dehydrogenase  51.95 
 
 
260 aa  278  6e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000268632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1530  short chain dehydrogenase  51.17 
 
 
263 aa  265  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5228  short chain dehydrogenase  50.39 
 
 
261 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.940368  normal  0.168178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4646  short chain dehydrogenase  51.95 
 
 
261 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5029  short chain dehydrogenase  51.95 
 
 
261 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.30549  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4734  short chain dehydrogenase  51.95 
 
 
261 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.332046  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.56 
 
 
258 aa  239  5e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.899503  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4372  short chain dehydrogenase  46.88 
 
 
279 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
259 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.670645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5492  short chain dehydrogenase  39.1 
 
 
263 aa  164  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
259 aa  159  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
265 aa  151  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1534  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 
263 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0157122  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
268 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8773  short chain dehydrogenase  35.25 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.22 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
258 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
257 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1601  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.786043  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5156  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 
254 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215894  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01588  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.15 
 
 
255 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
255 aa  119  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.444586  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1806  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.15 
 
 
255 aa  119  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
255 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2331  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.15 
 
 
255 aa  119  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2011  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.15 
 
 
255 aa  119  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617976  normal  0.65251 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1694  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.15 
 
 
255 aa  119  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01578  hypothetical protein  31.15 
 
 
255 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1580  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.15 
 
 
255 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.54 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1827  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.15 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.588184  normal  0.748301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
284 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 
286 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.317832 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 
286 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4742  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
263 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0144665  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4362  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
263 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
262 aa  115  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381392  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4448  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
263 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.63337  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  32.41 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146898  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.066838  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4577  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4960  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4665  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.393265  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245464  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
254 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 
262 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220115  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
248 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3160  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
248 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
248 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
253 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
248 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108758  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.564431  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
256 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.675058  normal  0.0165705 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
255 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
255 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
268 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1618  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.65 
 
 
255 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.455189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
256 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
255 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1561  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.65 
 
 
255 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
248 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
241 aa  111  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
253 aa  111  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.196322  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2001  putative short-chain alcohol dehydrogenase  38.06 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  33.73 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576946  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.31 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566144  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10945  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0419778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.86 
 
 
245 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
288 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
249 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
248 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6983  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129744  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.8 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
248 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>