More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1530 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1530  short chain dehydrogenase  100 
 
 
263 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5228  short chain dehydrogenase  94.23 
 
 
261 aa  500  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.940368  normal  0.168178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4646  short chain dehydrogenase  91.54 
 
 
261 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5029  short chain dehydrogenase  91.54 
 
 
261 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.30549  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4734  short chain dehydrogenase  91.54 
 
 
261 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.332046  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13563  short chain dehydrogenase  77.25 
 
 
260 aa  421  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000268632 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.08 
 
 
260 aa  305  4.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.81 
 
 
258 aa  286  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.899503  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.94 
 
 
258 aa  275  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00507501  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2833  short chain dehydrogenase  50.42 
 
 
258 aa  248  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2636  short chain dehydrogenase  51.17 
 
 
258 aa  245  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.842689  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4372  short chain dehydrogenase  47.49 
 
 
279 aa  218  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5492  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
263 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.670645 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
265 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1534  short chain dehydrogenase  35 
 
 
263 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0157122  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
268 aa  155  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
253 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
253 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108758  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
262 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381392  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
253 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.564431  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  32.41 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8773  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 
261 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
266 aa  125  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  32.02 
 
 
255 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
287 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0936  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  28.46 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.664798  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
287 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
253 aa  122  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
248 aa  122  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
256 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192127  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  31.52 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
257 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1306  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  31.58 
 
 
256 aa  118  7e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  28.12 
 
 
259 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.246968  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.27 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 
254 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
252 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  28.52 
 
 
265 aa  115  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
253 aa  115  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3989  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 
265 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.826773  normal  0.0182099 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5596  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 
265 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3663  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 
265 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4704  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 
265 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000843868  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.52 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4098  short chain dehydrogenase  31.52 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.474708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1825  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1682  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.92 
 
 
252 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  30.74 
 
 
254 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
260 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.136099 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
262 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3832  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
260 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.919217  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146898  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.62 
 
 
246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4562  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
248 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0570869  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1110  short chain dehydrogenase  30.74 
 
 
265 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0177225  normal  0.229286 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  30.74 
 
 
254 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 
261 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.64 
 
 
251 aa  112  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 
265 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576946  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
285 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4160  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.21 
 
 
962 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.312376  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
248 aa  112  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
235 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
254 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  30.74 
 
 
254 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4563  short chain dehydrogenase  31.13 
 
 
265 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00447639  hitchhiker  0.00143466 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0610  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.31 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3959  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 
253 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  28.29 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
252 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
285 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
252 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>