More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1110 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1110  short chain dehydrogenase  100 
 
 
265 aa  541  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0177225  normal  0.229286 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4563  short chain dehydrogenase  95.47 
 
 
265 aa  517  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00447639  hitchhiker  0.00143466 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4098  short chain dehydrogenase  95.85 
 
 
265 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.474708 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5596  short chain dehydrogenase  94.72 
 
 
265 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3663  short chain dehydrogenase  94.72 
 
 
265 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4704  short chain dehydrogenase  94.72 
 
 
265 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000843868  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3989  short chain dehydrogenase  93.21 
 
 
265 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.826773  normal  0.0182099 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0977  short chain dehydrogenase  83.4 
 
 
265 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1331  short chain dehydrogenase  83.4 
 
 
265 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2499  short chain dehydrogenase  83.4 
 
 
265 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1239  short chain dehydrogenase  83.4 
 
 
265 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0314  short chain dehydrogenase  83.4 
 
 
265 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0590  short chain dehydrogenase  83.4 
 
 
265 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155951  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1312  short chain dehydrogenase  83.4 
 
 
265 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.445214  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7064  short chain dehydrogenase  81.13 
 
 
265 aa  441  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1496  short chain dehydrogenase  82.31 
 
 
260 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0180  short chain dehydrogenase  80.67 
 
 
269 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4238  short chain dehydrogenase  80.6 
 
 
268 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3688  short chain dehydrogenase  65.53 
 
 
265 aa  345  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.332248  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3574  short chain dehydrogenase  62.78 
 
 
267 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11528  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4505  short chain dehydrogenase  64.29 
 
 
269 aa  332  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15196  normal  0.998314 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4637  short chain dehydrogenase  64.29 
 
 
269 aa  332  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0597104  normal  0.0798604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0958  short chain dehydrogenase  60.98 
 
 
265 aa  327  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3168  short chain dehydrogenase  62.36 
 
 
283 aa  318  7e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149072  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3959  short chain dehydrogenase  54.17 
 
 
264 aa  294  9e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0140  short chain dehydrogenase  53.7 
 
 
264 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0822  short chain dehydrogenase  55.81 
 
 
262 aa  265  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00305292  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00359465  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
259 aa  162  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
260 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
260 aa  152  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0610  putative short-chain dehydrogenase/reductase  33.33 
 
 
286 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0678259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
262 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
254 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.76 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.81 
 
 
251 aa  133  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
267 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
262 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
288 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
249 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
252 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.288132 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
252 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.43 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 
262 aa  126  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 
261 aa  126  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4369  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.43 
 
 
246 aa  125  7e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.7 
 
 
261 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
282 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458273  normal  0.643271 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
261 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
249 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 
254 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
250 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117153  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.46 
 
 
263 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 
261 aa  123  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
263 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0128625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.18 
 
 
252 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
247 aa  122  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
290 aa  122  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.19 
 
 
262 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.68 
 
 
247 aa  122  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1284  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.35 
 
 
251 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.183563 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2494  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.31 
 
 
248 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000082608  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
254 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
261 aa  122  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3267  putative short chain dehydrogenase/reductase  34.21 
 
 
249 aa  121  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2721  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1154  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  28.46 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000294561  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2042  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.03 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000691929  decreased coverage  0.00609535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 
263 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0991  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  28.46 
 
 
253 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.35 
 
 
249 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
295 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.85 
 
 
255 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
266 aa  119  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 
250 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0741311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
262 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11468  acetoin(diacetyl)reductase  32.45 
 
 
254 aa  118  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0328388  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
260 aa  118  9e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1221  ketoacyl reductase  33.46 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432142  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.196322  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  31.8 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2624  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000523839  unclonable  0.000000000127004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>