More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5596 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5596  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 265 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3663  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 265 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4704  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 265 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000843868  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4098  short chain dehydrogenase  95.09 
 
 		 265 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.474708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1110  short chain dehydrogenase  94.72 
 
 		 265 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0177225  normal  0.229286 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4563  short chain dehydrogenase  93.96 
 
 		 265 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00447639  hitchhiker  0.00143466 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3989  short chain dehydrogenase  92.45 
 
 		 265 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.826773  normal  0.0182099 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1331  short chain dehydrogenase  85.66 
 
 		 265 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2499  short chain dehydrogenase  85.66 
 
 		 265 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1239  short chain dehydrogenase  85.66 
 
 		 265 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0977  short chain dehydrogenase  85.66 
 
 		 265 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0314  short chain dehydrogenase  85.66 
 
 		 265 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0590  short chain dehydrogenase  85.66 
 
 		 265 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155951  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1312  short chain dehydrogenase  85.66 
 
 		 265 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.445214  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1496  short chain dehydrogenase  83.85 
 
 		 260 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7064  short chain dehydrogenase  81.89 
 
 		 265 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0180  short chain dehydrogenase  81.04 
 
 		 269 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4238  short chain dehydrogenase  81.34 
 
 		 268 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3688  short chain dehydrogenase  64.77 
 
 		 265 aa  344  7e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.332248  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3574  short chain dehydrogenase  64.18 
 
 		 267 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11528  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4637  short chain dehydrogenase  65.3 
 
 		 269 aa  333  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0597104  normal  0.0798604 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4505  short chain dehydrogenase  65.3 
 
 		 269 aa  333  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15196  normal  0.998314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0958  short chain dehydrogenase  61.74 
 
 		 265 aa  327  9e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3168  short chain dehydrogenase  63.91 
 
 		 283 aa  325  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149072  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3959  short chain dehydrogenase  54.92 
 
 		 264 aa  299  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0140  short chain dehydrogenase  52.53 
 
 		 264 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0822  short chain dehydrogenase  56.2 
 
 		 262 aa  265  8e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00305292  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 		 259 aa  166  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 362 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00359465  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0610  putative short-chain dehydrogenase/reductase  34.09 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0678259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 		 294 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 		 262 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.42 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 		 266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 		 254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 		 267 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.11 
 
 		 263 aa  135  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.288132 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.4 
 
 		 255 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4369  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.1 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.19 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 		 271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 262 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 		 262 aa  128  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 		 261 aa  128  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.46 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  32.18 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 263 aa  125  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0128625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 269 aa  125  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 259 aa  125  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 263 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1284  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.17 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.183563 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 		 250 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0741311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 249 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.81 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 		 249 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1221  ketoacyl reductase  35.11 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432142  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2494  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.97 
 
 		 248 aa  122  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000082608  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 261 aa  122  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 254 aa  121  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.7 
 
 		 263 aa  121  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 		 255 aa  121  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 282 aa  121  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458273  normal  0.643271 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 260 aa  122  9e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 254 aa  121  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.03 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  34.11 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  33.08 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>