More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1392 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
261 aa  518  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.33 
 
 
261 aa  402  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.92 
 
 
261 aa  322  4e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.24 
 
 
260 aa  305  4.0000000000000004e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.53 
 
 
262 aa  302  4.0000000000000003e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.31 
 
 
262 aa  288  8e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 
262 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
261 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 
262 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
263 aa  185  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
267 aa  180  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
260 aa  180  2e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
259 aa  177  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0333473 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
261 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
261 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
263 aa  167  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.64 
 
 
261 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.199007  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1821  short chain dehydrogenase  38.76 
 
 
264 aa  167  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
261 aa  167  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
259 aa  167  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0734499  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
260 aa  157  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
271 aa  152  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1391  NAD/NADP dependent oxidoreductase  35.88 
 
 
261 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3959  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 
264 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849421 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
255 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0149136  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3989  short chain dehydrogenase  32.32 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.826773  normal  0.0182099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354255 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3574  short chain dehydrogenase  32.44 
 
 
267 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11528  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
259 aa  138  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4505  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 
269 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15196  normal  0.998314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
258 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0140  short chain dehydrogenase  32.32 
 
 
264 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4637  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 
269 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0597104  normal  0.0798604 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4098  short chain dehydrogenase  30.8 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.474708 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
253 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.196322  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1110  short chain dehydrogenase  31.18 
 
 
265 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0177225  normal  0.229286 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3663  short chain dehydrogenase  31.18 
 
 
265 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4704  short chain dehydrogenase  31.18 
 
 
265 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000843868  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5596  short chain dehydrogenase  31.18 
 
 
265 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.389039  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4238  short chain dehydrogenase  31.2 
 
 
268 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1496  short chain dehydrogenase  34.23 
 
 
260 aa  135  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1331  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000437524  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2499  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
265 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1312  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
265 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.445214  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1239  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
265 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0977  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0314  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0590  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155951  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4563  short chain dehydrogenase  31.18 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00447639  hitchhiker  0.00143466 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 
256 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 
237 aa  133  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
254 aa  133  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.131558 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2186  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  34.11 
 
 
263 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1983  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
263 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
237 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
260 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
262 aa  131  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.80685  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
263 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
262 aa  131  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
259 aa  129  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.560822  normal  0.0105475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
250 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.274647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0058487  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.861645  normal  0.226141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7064  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
261 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.203638  normal  0.0877648 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3419  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
247 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
261 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283398  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
266 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 
261 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.696622  normal  0.57076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
260 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 
268 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0180  short chain dehydrogenase  29.59 
 
 
269 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3440  putative short chain dehydrogenase  37.97 
 
 
261 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
259 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336154  normal  0.942948 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.96 
 
 
249 aa  122  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
259 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5202  putative oxidoreductase protein  34.5 
 
 
275 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07435  putative short-chain dehydrogenase/reductase  30.15 
 
 
269 aa  123  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.492431  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 
260 aa  122  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1210  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.82 
 
 
260 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.475284  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 
265 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
259 aa  122  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00522333  unclonable  4.08177e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>