More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0958 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0958  short chain dehydrogenase  100 
 
 
265 aa  537  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3688  short chain dehydrogenase  79.23 
 
 
265 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.332248  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4505  short chain dehydrogenase  77.15 
 
 
269 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15196  normal  0.998314 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4637  short chain dehydrogenase  77.15 
 
 
269 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0597104  normal  0.0798604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3168  short chain dehydrogenase  76.89 
 
 
283 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149072  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3574  short chain dehydrogenase  72.24 
 
 
267 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11528  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7064  short chain dehydrogenase  63.26 
 
 
265 aa  343  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0180  short chain dehydrogenase  61.19 
 
 
269 aa  333  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4238  short chain dehydrogenase  61.42 
 
 
268 aa  330  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3989  short chain dehydrogenase  61.74 
 
 
265 aa  328  6e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.826773  normal  0.0182099 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3663  short chain dehydrogenase  61.74 
 
 
265 aa  327  9e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5596  short chain dehydrogenase  61.74 
 
 
265 aa  327  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329102 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4704  short chain dehydrogenase  61.74 
 
 
265 aa  327  9e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000843868  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1110  short chain dehydrogenase  60.98 
 
 
265 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0177225  normal  0.229286 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4098  short chain dehydrogenase  61.36 
 
 
265 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.474708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4563  short chain dehydrogenase  61.36 
 
 
265 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00447639  hitchhiker  0.00143466 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1331  short chain dehydrogenase  61.36 
 
 
265 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2499  short chain dehydrogenase  61.36 
 
 
265 aa  322  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0977  short chain dehydrogenase  61.36 
 
 
265 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1312  short chain dehydrogenase  61.36 
 
 
265 aa  322  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.445214  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1239  short chain dehydrogenase  61.36 
 
 
265 aa  322  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0314  short chain dehydrogenase  61.36 
 
 
265 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0590  short chain dehydrogenase  61.36 
 
 
265 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155951  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1496  short chain dehydrogenase  61.39 
 
 
260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3959  short chain dehydrogenase  52.85 
 
 
264 aa  292  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0140  short chain dehydrogenase  55.77 
 
 
264 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0822  short chain dehydrogenase  58.04 
 
 
262 aa  271  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00305292  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
259 aa  145  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
260 aa  145  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
362 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00359465  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32556  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0610  putative short-chain dehydrogenase/reductase  30.94 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0678259 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
254 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3832  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
260 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.919217  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
260 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.136099 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 
261 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
267 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
264 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2299  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.11 
 
 
245 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
250 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
249 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
249 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0450975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.27 
 
 
262 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00620  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  35.04 
 
 
260 aa  122  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.297652  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12220  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1769  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.82 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0408517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.84 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 
254 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 
261 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
267 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.03 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.18 
 
 
249 aa  119  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
249 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 
282 aa  118  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458273  normal  0.643271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
249 aa  118  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  32.54 
 
 
252 aa  118  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0156103  normal  0.420839 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.718128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 
288 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1422  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1835  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0909527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0281  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  35.85 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 
347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.91 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 
256 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
262 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1154  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  25.57 
 
 
253 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000294561  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.62 
 
 
261 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
249 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0895  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.82 
 
 
245 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0373369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.288132 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0509  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.02 
 
 
245 aa  115  5e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.01 
 
 
271 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.68 
 
 
245 aa  115  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.82564  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0458  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.68 
 
 
245 aa  115  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  31.72 
 
 
261 aa  116  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 
261 aa  116  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>