More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2582 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
262 aa  522  1e-147  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  85.11 
 
 
262 aa  421  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.73 
 
 
261 aa  336  2.9999999999999997e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.42 
 
 
260 aa  331  6e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.59 
 
 
261 aa  323  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.53 
 
 
261 aa  288  4e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.51 
 
 
261 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.74 
 
 
261 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 
267 aa  215  5e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.17 
 
 
262 aa  211  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
263 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
261 aa  202  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
262 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
262 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0333473 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.54 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
260 aa  172  5e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
261 aa  172  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.199007  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
263 aa  169  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
259 aa  162  6e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.54 
 
 
248 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0734499  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
261 aa  159  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
259 aa  159  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
255 aa  158  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0149136  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
259 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000437524  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
260 aa  158  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
262 aa  155  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.80685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.196322  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1210  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.77 
 
 
260 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.475284  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
263 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1391  NAD/NADP dependent oxidoreductase  39.92 
 
 
261 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1983  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
263 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1821  short chain dehydrogenase  36.54 
 
 
264 aa  152  8e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5619  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
277 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0753007  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 
259 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199675 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
259 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
258 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.298877  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
285 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0641216  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
259 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.400056 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2186  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  38.76 
 
 
263 aa  148  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336154  normal  0.942948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00522333  unclonable  4.08177e-18 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
237 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2540  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.55 
 
 
258 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
278 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
259 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
265 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
294 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
260 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16730  glucose/ribitol dehydrogenase family protein  38.31 
 
 
262 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.681173  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 
259 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.560822  normal  0.0105475 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
247 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 
259 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0406347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
253 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
258 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.567568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
260 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.389039  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
259 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154867  normal  0.0871554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
262 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3257  putative 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  38.22 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.53 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.26 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.482868  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3053  oxidoreductase  39.77 
 
 
260 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.42458  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
259 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.861645  normal  0.226141 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.285403  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1017  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.37 
 
 
325 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
265 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
262 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 
268 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 
263 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
261 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.274647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
266 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7064  short chain dehydrogenase  35.25 
 
 
265 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
260 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 
276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1080  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.01 
 
 
276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736401  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
263 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3574  short chain dehydrogenase  31.03 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0789  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.98 
 
 
259 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0355352  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1882  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.98 
 
 
259 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0361  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.98 
 
 
259 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0730868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1078  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.98 
 
 
259 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.296983  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0180  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 
269 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1243  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.98 
 
 
259 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00809972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1234  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.98 
 
 
259 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
362 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00359465  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 
253 aa  132  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 
262 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
267 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03629  oxidoreductase  35.8 
 
 
258 aa  132  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>