More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5492 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5492  short chain dehydrogenase  100 
 
 
263 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1534  short chain dehydrogenase  75.67 
 
 
263 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0157122  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2219  short chain dehydrogenase  95.27 
 
 
169 aa  338  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.94 
 
 
259 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.670645 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
265 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.56 
 
 
262 aa  202  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381392  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 
268 aa  202  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5228  short chain dehydrogenase  40.38 
 
 
261 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.940368  normal  0.168178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.53 
 
 
258 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00507501  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5029  short chain dehydrogenase  41.15 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.30549  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4646  short chain dehydrogenase  41.15 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4734  short chain dehydrogenase  41.15 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.332046  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1530  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
263 aa  179  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13563  short chain dehydrogenase  39.23 
 
 
260 aa  176  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000268632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8773  short chain dehydrogenase  40.23 
 
 
261 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2636  short chain dehydrogenase  39.1 
 
 
258 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.842689  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.899503  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4372  short chain dehydrogenase  38.7 
 
 
279 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2833  short chain dehydrogenase  38.72 
 
 
258 aa  139  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 
249 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
249 aa  125  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
249 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0450975 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
253 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 
249 aa  122  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0732  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  32.06 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.8 
 
 
247 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
254 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0258116  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
249 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  28.96 
 
 
265 aa  115  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.09 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 
249 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
245 aa  112  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
254 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  31.94 
 
 
260 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4414  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
249 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  30.71 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.46 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.46 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0751362 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
248 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
294 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.06 
 
 
245 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
249 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3955  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.56 
 
 
249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  28.63 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.58 
 
 
246 aa  109  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.97 
 
 
260 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3267  putative short chain dehydrogenase/reductase  32.33 
 
 
249 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0777  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.98 
 
 
249 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0610  putative short-chain dehydrogenase/reductase  32.08 
 
 
286 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0678259 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.45 
 
 
255 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
239 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 
260 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
249 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
262 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2249  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 
260 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000113674  decreased coverage  1.89116e-19 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
250 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
282 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458273  normal  0.643271 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
287 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 
270 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.27 
 
 
260 aa  107  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0727  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.59 
 
 
249 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 
255 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 
285 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 
252 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
252 aa  105  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.53 
 
 
246 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
254 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.53 
 
 
246 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0994  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.77 
 
 
247 aa  105  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0983572  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
293 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 
260 aa  105  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3481  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.45 
 
 
259 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
257 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0928  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 
263 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
252 aa  105  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
285 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
285 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
264 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.92 
 
 
246 aa  105  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2721  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 
249 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  31.18 
 
 
256 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04660  2-hydroxycyclohexane-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  32.31 
 
 
261 aa  104  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
263 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.45 
 
 
247 aa  104  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0936  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  29.41 
 
 
255 aa  104  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.664798  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
245 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 
250 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>