More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8773 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8773  short chain dehydrogenase  100 
 
 
261 aa  523  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5492  short chain dehydrogenase  40.23 
 
 
263 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
258 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00507501  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1534  short chain dehydrogenase  41.73 
 
 
263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0157122  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
259 aa  145  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.670645 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13563  short chain dehydrogenase  35 
 
 
260 aa  142  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000268632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5228  short chain dehydrogenase  33.08 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.940368  normal  0.168178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
265 aa  135  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1530  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5029  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.30549  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4646  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4734  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.332046  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.96 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
259 aa  129  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4372  short chain dehydrogenase  34.23 
 
 
279 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
261 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 
288 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2636  short chain dehydrogenase  35.25 
 
 
258 aa  125  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.842689  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
258 aa  125  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.899503  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
254 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
254 aa  121  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
264 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0027  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.95 
 
 
245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.657901 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0030  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  32.95 
 
 
245 aa  119  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 
262 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381392  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  32.16 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549001  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2219  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
169 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2833  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
263 aa  115  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.721614  normal  0.0286411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
254 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.01 
 
 
285 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3692  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31077  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19210  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.15 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245222 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2784  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.01 
 
 
254 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.330689  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.92 
 
 
262 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2147  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.2 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.760058  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.546475  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346785  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
255 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
286 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.83 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
270 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03679  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_4G05870)  28.96 
 
 
302 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0128592 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5588  dehydrogenase  28.68 
 
 
285 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20330  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
281 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.84 
 
 
246 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.24 
 
 
268 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3563  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.84 
 
 
246 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125613 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.59 
 
 
252 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3264  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.84 
 
 
246 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 
295 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2411  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.22 
 
 
260 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.520745  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0133  short chain dehydrogenase  34.21 
 
 
256 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 
285 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
254 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.38 
 
 
249 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
269 aa  105  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  30.92 
 
 
286 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.3 
 
 
261 aa  105  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 
252 aa  105  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7370  short-chain alcohol dehydrogenase  32.68 
 
 
247 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.3 
 
 
261 aa  105  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.15 
 
 
294 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 
285 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.43 
 
 
261 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
255 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2646  sorbitol dehydrogenase  32.95 
 
 
258 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.46 
 
 
246 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.46 
 
 
246 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.01 
 
 
285 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
267 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  33.33 
 
 
258 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4032  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 
268 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 
286 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 
285 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539155  normal  0.142405 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4334  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 
268 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2622  sorbitol dehydrogenase  34.09 
 
 
258 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 
285 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
261 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.12 
 
 
249 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
291 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.608035  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2514  sorbitol dehydrogenase  32.95 
 
 
258 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.449953 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
252 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
246 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  32.82 
 
 
254 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1988  sorbitol dehydrogenase  33.97 
 
 
276 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.921173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2001  putative short-chain alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
262 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2598  sorbitol dehydrogenase  33.97 
 
 
276 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.07 
 
 
246 aa  102  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
311 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
249 aa  102  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>