More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2833 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2833  short chain dehydrogenase  100 
 
 
258 aa  511  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2636  short chain dehydrogenase  91.47 
 
 
258 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.842689  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.5 
 
 
258 aa  343  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00507501  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13563  short chain dehydrogenase  51.56 
 
 
260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000268632 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.95 
 
 
260 aa  276  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1530  short chain dehydrogenase  51.17 
 
 
263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5228  short chain dehydrogenase  50.39 
 
 
261 aa  268  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.940368  normal  0.168178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4646  short chain dehydrogenase  52.55 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5029  short chain dehydrogenase  52.55 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.30549  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4734  short chain dehydrogenase  52.55 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.332046  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.56 
 
 
258 aa  238  5e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.899503  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4372  short chain dehydrogenase  46.88 
 
 
279 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
259 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.670645 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5492  short chain dehydrogenase  38.81 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
265 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1534  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0157122  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 
268 aa  141  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8773  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
261 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5156  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 
254 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215894  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1601  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 
253 aa  122  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.786043  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
263 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146898  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576946  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4362  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4448  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.63337  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4742  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0144665  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.22 
 
 
249 aa  119  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
255 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.588184  normal  0.748301 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01588  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.13 
 
 
255 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 
255 aa  119  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.444586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01578  hypothetical protein  31.13 
 
 
255 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1694  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.13 
 
 
255 aa  119  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2331  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.13 
 
 
255 aa  119  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2011  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.13 
 
 
255 aa  119  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617976  normal  0.65251 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1806  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.13 
 
 
255 aa  119  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1580  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.13 
 
 
255 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5349  1,6-dihydroxycyclohexa-2,4-diene-1-carboxylate dehydrogenase  35.18 
 
 
259 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.571723  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4577  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 
253 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4665  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 
253 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4960  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 
253 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.066838  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.92 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1827  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.13 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.393265  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  35.29 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
255 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0936  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  28.35 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.664798  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
257 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
284 aa  115  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
254 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
254 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
255 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 
254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4921  short chain dehydrogenase  37.01 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506755  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1825  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3160  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
288 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.675058  normal  0.0165705 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.317832 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10784  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
287 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  29.64 
 
 
286 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
255 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0912  1,6-dihydroxycyclohexa-2,4-diene-1-carboxylate dehydrogenase  33.85 
 
 
262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.609655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
250 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
253 aa  112  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.196322  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
285 aa  111  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
268 aa  111  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10945  short chain dehydrogenase  37.01 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0201  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.24 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.52 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.64 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
258 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.07 
 
 
249 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
256 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192127  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.18 
 
 
260 aa  110  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5688  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.57 
 
 
260 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.22798  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1031  putative short-chain alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.394755 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381392  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
254 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4745  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
254 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146753  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
258 aa  108  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465274  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
266 aa  108  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 
285 aa  108  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566144  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2072  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
247 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000027021  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
249 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 
297 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
249 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
249 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.120513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>