More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5228 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5228  short chain dehydrogenase  100 
 
 
261 aa  533  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.940368  normal  0.168178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1530  short chain dehydrogenase  94.23 
 
 
263 aa  500  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5029  short chain dehydrogenase  92.34 
 
 
261 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.30549  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4646  short chain dehydrogenase  92.34 
 
 
261 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4734  short chain dehydrogenase  92.34 
 
 
261 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.332046  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13563  short chain dehydrogenase  77.43 
 
 
260 aa  425  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000268632 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.86 
 
 
260 aa  301  9e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.42 
 
 
258 aa  285  7e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.899503  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.94 
 
 
258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00507501  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2833  short chain dehydrogenase  49.58 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2636  short chain dehydrogenase  50.39 
 
 
258 aa  242  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.842689  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4372  short chain dehydrogenase  48.45 
 
 
279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5492  short chain dehydrogenase  40.38 
 
 
263 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
259 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.670645 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
259 aa  175  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
265 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1534  short chain dehydrogenase  36.15 
 
 
263 aa  165  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0157122  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
251 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 
262 aa  138  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381392  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
253 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
253 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108758  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
253 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.564431  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
297 aa  132  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8773  short chain dehydrogenase  33.08 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  32.3 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0936  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  29.23 
 
 
255 aa  129  6e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.664798  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 
287 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  32.41 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192127  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
255 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
252 aa  125  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  29.69 
 
 
259 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
266 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
255 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
258 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
251 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 
255 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
263 aa  123  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
253 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
248 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
248 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
248 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 
285 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
265 aa  121  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576946  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
285 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
254 aa  121  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
285 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  28.91 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
283 aa  119  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1306  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  32.33 
 
 
256 aa  120  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
262 aa  119  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 
254 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
255 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.588184  normal  0.748301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.56 
 
 
249 aa  118  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
261 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4562  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
248 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0570869  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 
254 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
255 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.246968  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 
249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3832  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 
260 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.919217  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30 
 
 
246 aa  115  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
252 aa  115  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
249 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
248 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 
253 aa  115  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.143298  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 
260 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.136099 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
248 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
262 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 
285 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4160  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.71 
 
 
962 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.312376  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.94 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  31.23 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.34 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3763  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.566112  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5596  short chain dehydrogenase  32.3 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329102 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.43 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.23 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3663  short chain dehydrogenase  32.3 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>