More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0274 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0274  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 		 662 aa  1315    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.16 
 
 		 720 aa  613  9.999999999999999e-175  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.4 
 
 		 713 aa  550  1e-155  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  42.36 
 
 		 720 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.26 
 
 		 713 aa  547  1e-154  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  41.7 
 
 		 721 aa  543  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  42.5 
 
 		 720 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.11 
 
 		 713 aa  545  1e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  42.44 
 
 		 722 aa  535  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.74 
 
 		 712 aa  535  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  41.13 
 
 		 718 aa  535  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.48 
 
 		 722 aa  525  1e-148  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  41.09 
 
 		 718 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  40.68 
 
 		 718 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  38.66 
 
 		 717 aa  510  1e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.58 
 
 		 716 aa  508  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.58 
 
 		 716 aa  508  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  41 
 
 		 722 aa  504  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.55 
 
 		 722 aa  503  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.29 
 
 		 722 aa  499  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  40.57 
 
 		 722 aa  501  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.86 
 
 		 722 aa  498  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  40.57 
 
 		 724 aa  498  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  38.88 
 
 		 716 aa  492  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  39.71 
 
 		 722 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  39.86 
 
 		 724 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  39.86 
 
 		 724 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  39.86 
 
 		 724 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  40.03 
 
 		 727 aa  495  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  39.86 
 
 		 722 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  41.19 
 
 		 721 aa  492  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  39.71 
 
 		 722 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.52 
 
 		 724 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  42 
 
 		 718 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  40.23 
 
 		 760 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.04 
 
 		 726 aa  481  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.59 
 
 		 706 aa  481  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1012  tex protein, putative  40.43 
 
 		 817 aa  477  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  41.19 
 
 		 728 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  37.08 
 
 		 763 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  36.72 
 
 		 761 aa  473  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  37.64 
 
 		 757 aa  472  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  39.47 
 
 		 762 aa  475  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  41.93 
 
 		 762 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  40.94 
 
 		 719 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  40.94 
 
 		 719 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2655  RNA binding S1  37.26 
 
 		 804 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.047572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  39.12 
 
 		 719 aa  466  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  38.3 
 
 		 772 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.15 
 
 		 774 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3743  hypothetical protein  37.38 
 
 		 791 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0170  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.6 
 
 		 791 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  38.71 
 
 		 765 aa  465  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1079  Tex-like protein protein-like protein  39.42 
 
 		 704 aa  465  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2413  RNA binding S1 domain protein  37.59 
 
 		 736 aa  463  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.746859  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3982  hypothetical protein  37.6 
 
 		 791 aa  465  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0356  Tex-like protein protein-like protein  37.9 
 
 		 703 aa  465  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2028  RNA binding S1 domain protein  40.67 
 
 		 707 aa  461  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.06 
 
 		 774 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  38.27 
 
 		 772 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3374  RNA-binding S1 domain-containing protein  37 
 
 		 786 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  37.73 
 
 		 759 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0747  RNA binding S1 domain protein  41.55 
 
 		 699 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.338297  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  37.8 
 
 		 773 aa  462  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  38.6 
 
 		 775 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.71 
 
 		 723 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  39.79 
 
 		 705 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  37.69 
 
 		 861 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4967  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.57 
 
 		 774 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0270  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.64 
 
 		 774 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  38.34 
 
 		 773 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2891  hypothetical protein  39.97 
 
 		 789 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2746  hypothetical protein  39.97 
 
 		 789 aa  458  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  37.14 
 
 		 772 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  37.64 
 
 		 774 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1021  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.04 
 
 		 707 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.974178  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0405  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.21 
 
 		 772 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  38.38 
 
 		 754 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.92 
 
 		 774 aa  456  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  37.18 
 
 		 802 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0774  RNA binding protein  37.63 
 
 		 773 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394483  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2430  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.9 
 
 		 773 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.388315  normal  0.0422366 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2537  RNA binding S1  36.45 
 
 		 803 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417013 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3912  RNA binding S1 domain protein  36.39 
 
 		 777 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  36.8 
 
 		 772 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1875  Tex-like protein protein-like protein  38.44 
 
 		 719 aa  454  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4627  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.94 
 
 		 777 aa  455  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0291  RNA binding S1 domain protein  36.97 
 
 		 710 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  38.78 
 
 		 730 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3421  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.74 
 
 		 788 aa  455  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.507063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  36.68 
 
 		 773 aa  451  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0767  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.29 
 
 		 720 aa  451  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  36.54 
 
 		 777 aa  450  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0306  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.68 
 
 		 773 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05040  transcriptional accessory protein  37.23 
 
 		 770 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.948642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1942  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.97 
 
 		 778 aa  450  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0410513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0235  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.59 
 
 		 790 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0320  RNA binding S1 domain protein  36.67 
 
 		 775 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  39.48 
 
 		 710 aa  449  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  37.01 
 
 		 766 aa  451  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>