More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0214 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0214  site-specific recombinase XerD  100 
 
 		 277 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1515  integrase family protein  44 
 
 		 308 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3501  integrase family protein  44.7 
 
 		 309 aa  185  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3692  integrase family protein  35.56 
 
 		 296 aa  169  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0116  site-specific recombinase XerD-like  59.38 
 
 		 127 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1095  phage integrase  39.52 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1619  integrase family protein  35.61 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.771515  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3569  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0892176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1863  integrase family protein  32.82 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6221  site-specific recombinase XerD-like protein  43.66 
 
 		 142 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  33.2 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  33.2 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  33.2 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  30.12 
 
 		 319 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  32.26 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  33.07 
 
 		 307 aa  95.9  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  26.51 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  28.71 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  28.76 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  30.7 
 
 		 294 aa  89  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  30.77 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  27.35 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  31.02 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  28.71 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  28.71 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3835  tyrosine recombinase XerC  32.11 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.955587  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  28.57 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  28.38 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  30.53 
 
 		 304 aa  85.5  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  27.27 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1455  integrase family protein  30.07 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  27.41 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  32.22 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  29.73 
 
 		 298 aa  82  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  29.26 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  27.43 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  29.83 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  28.95 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  32.24 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.05 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.05 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  29.46 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  30.88 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.11 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.62 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  27.71 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0902  integrase family protein  30.51 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  29.3 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  29.58 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  22.57 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.12 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3052  phage integrase  39.13 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.378569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.79 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  24.34 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  25.76 
 
 		 299 aa  78.6  0.00000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  27.51 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  26.32 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  26.75 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.58 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.57 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  27.11 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.43 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.76 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5707  integrase domain protein SAM domain protein  26.34 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  28.51 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  30.63 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  31.67 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  26.03 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  26.94 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0872  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2439  integrase family protein  30.08 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000285613  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  28.29 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  29.87 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  23.36 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0602  phage integrase family protein  27.51 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  23.79 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  29.24 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  24.07 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0196  integrase family protein  29.09 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000565414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  26.92 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.94 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.96 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.76 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  28.39 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0170  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.31 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  23.79 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.96 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.96 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.96 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.96 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  27.35 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.96 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.96 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  27.6 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  28.99 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  30.14 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.96 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.56 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0393  tyrosine recombinase XerC  30.3 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>