147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3340 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3340  collagen triple helix repeat-containing protein  100 
 
 		 274 aa  536  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.623984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  35.67 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 400 aa  89  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  54.26 
 
 		 689 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  58.76 
 
 		 2914 aa  86.3  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1848  Collagen triple helix repeat protein  47.33 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152171  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  54.12 
 
 		 2851 aa  82.8  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  56.98 
 
 		 523 aa  82.4  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  54.65 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  57.89 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  42.86 
 
 		 437 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  52.48 
 
 		 434 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  58.02 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  41.67 
 
 		 645 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  55.56 
 
 		 582 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  42.24 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  59.78 
 
 		 512 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  58.06 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  62.03 
 
 		 643 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  50 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  51.92 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  55.81 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  55.81 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  51.92 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  51.92 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  50.93 
 
 		 585 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  57.47 
 
 		 382 aa  72.4  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  42.95 
 
 		 442 aa  72.4  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  55.68 
 
 		 438 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  38.51 
 
 		 1426 aa  72  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  49.02 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  50.96 
 
 		 712 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  41.77 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  41.61 
 
 		 1101 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  60.27 
 
 		 839 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3339  triple helix repeat-containing collagen  38.26 
 
 		 158 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.487784  normal  0.022781 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  55.81 
 
 		 706 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  51.09 
 
 		 813 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  32.53 
 
 		 444 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  45.13 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  30 
 
 		 842 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2409  hypothetical protein  36.72 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242823  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  47.86 
 
 		 1321 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  37.88 
 
 		 473 aa  65.5  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  47.62 
 
 		 582 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  56.82 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  55.95 
 
 		 1168 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  52.33 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  58.67 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  47.01 
 
 		 1297 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  52.05 
 
 		 580 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  57.3 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1245  Collagen triple helix repeat protein  42.28 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.160346  normal  0.403174 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  43.9 
 
 		 587 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  36.63 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  63.01 
 
 		 951 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  36.14 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  50.52 
 
 		 835 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  50.6 
 
 		 1147 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  47.19 
 
 		 466 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  42.86 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  56.32 
 
 		 835 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  57.47 
 
 		 835 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  40.68 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  46.34 
 
 		 644 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  46.67 
 
 		 936 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0623  triple helix repeat-containing collagen  49.38 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  54.02 
 
 		 748 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  36.2 
 
 		 493 aa  60.1  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  36.15 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  47.79 
 
 		 1170 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  43.62 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  43.62 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  36.26 
 
 		 717 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  51.61 
 
 		 934 aa  58.9  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  48.45 
 
 		 867 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  47.42 
 
 		 838 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  43.81 
 
 		 1421 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  43 
 
 		 648 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  43.62 
 
 		 474 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  50.65 
 
 		 767 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  48.84 
 
 		 1451 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  46.39 
 
 		 1580 aa  55.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  39.62 
 
 		 815 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  31.71 
 
 		 688 aa  55.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  39.05 
 
 		 524 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  45.22 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  42.68 
 
 		 462 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  40.78 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  40.34 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  44.57 
 
 		 639 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  40.66 
 
 		 469 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  54.65 
 
 		 222 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0879  Collagen triple helix repeat protein  35.06 
 
 		 328 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  47.83 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  48.75 
 
 		 835 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  42.05 
 
 		 1219 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  40.66 
 
 		 426 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  40.66 
 
 		 647 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  50.72 
 
 		 953 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>