104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1671 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  100 
 
 		 593 aa  1222    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  52.23 
 
 		 606 aa  596  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  52.23 
 
 		 606 aa  594  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  54 
 
 		 611 aa  588  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  37.23 
 
 		 558 aa  356  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  35.45 
 
 		 581 aa  355  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  35.1 
 
 		 581 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  34.91 
 
 		 602 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  35.56 
 
 		 581 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  34 
 
 		 604 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  36.8 
 
 		 550 aa  309  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  32.82 
 
 		 588 aa  302  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  32.75 
 
 		 563 aa  290  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  33.44 
 
 		 583 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  32.56 
 
 		 602 aa  280  6e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  30.23 
 
 		 585 aa  183  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  26.55 
 
 		 552 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  25.84 
 
 		 557 aa  172  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  27.79 
 
 		 565 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  25.26 
 
 		 574 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  25.93 
 
 		 568 aa  158  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  25.12 
 
 		 581 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  25.78 
 
 		 556 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  22.72 
 
 		 579 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  25.65 
 
 		 581 aa  148  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  23.55 
 
 		 572 aa  147  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  23.83 
 
 		 571 aa  146  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  24.72 
 
 		 521 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  22.01 
 
 		 543 aa  143  7e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  25.16 
 
 		 553 aa  141  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  26.19 
 
 		 563 aa  141  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  26.19 
 
 		 563 aa  141  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  26.38 
 
 		 577 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  25.61 
 
 		 491 aa  140  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  24.49 
 
 		 566 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  24.41 
 
 		 586 aa  136  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  25.93 
 
 		 564 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  24.28 
 
 		 569 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  24.28 
 
 		 561 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  25.14 
 
 		 529 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  21.99 
 
 		 541 aa  133  7.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  25 
 
 		 530 aa  133  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  22.98 
 
 		 591 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  25.59 
 
 		 534 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  25.23 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  25.96 
 
 		 503 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  24.3 
 
 		 535 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  25.41 
 
 		 534 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  24.47 
 
 		 546 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  22.81 
 
 		 590 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  22.81 
 
 		 562 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  24.54 
 
 		 573 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  26.4 
 
 		 574 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  25.1 
 
 		 540 aa  124  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  23.32 
 
 		 535 aa  124  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  24.6 
 
 		 577 aa  124  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  44.76 
 
 		 163 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  23.21 
 
 		 498 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  22.26 
 
 		 569 aa  121  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  22.2 
 
 		 564 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  25.33 
 
 		 565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  22.74 
 
 		 537 aa  111  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  21.42 
 
 		 590 aa  111  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  21.42 
 
 		 590 aa  111  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  21.42 
 
 		 590 aa  111  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  23.75 
 
 		 581 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  23.63 
 
 		 562 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  23.63 
 
 		 562 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  23.39 
 
 		 561 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  22.59 
 
 		 580 aa  109  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  23.48 
 
 		 545 aa  108  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  22 
 
 		 537 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  23.76 
 
 		 542 aa  107  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  23.94 
 
 		 542 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  23.53 
 
 		 540 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  22.73 
 
 		 562 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  22.73 
 
 		 562 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  23.46 
 
 		 561 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  23.02 
 
 		 535 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  23.43 
 
 		 562 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  21.98 
 
 		 565 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  23.82 
 
 		 510 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  22.69 
 
 		 535 aa  98.2  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  23.78 
 
 		 849 aa  97.1  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  29.91 
 
 		 556 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1117  phage terminase  21.61 
 
 		 629 aa  80.9  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  23.21 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  28.57 
 
 		 169 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  24.86 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  25.78 
 
 		 229 aa  65.5  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  26.47 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2607  phage terminase  19.87 
 
 		 558 aa  63.9  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1649  Phage terminase-like protein, large subunit  21.54 
 
 		 626 aa  60.5  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  23.28 
 
 		 455 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  20.16 
 
 		 570 aa  54.7  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2261  hypothetical protein  42.11 
 
 		 131 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.051651  normal  0.80364 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  19.74 
 
 		 555 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  23.53 
 
 		 215 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  22.62 
 
 		 584 aa  50.8  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3592  terminase  19.12 
 
 		 555 aa  50.4  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>