137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1088 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  100 
 
 		 535 aa  1122    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  83.46 
 
 		 534 aa  936    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  76.01 
 
 		 849 aa  733    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  79.17 
 
 		 535 aa  881    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  83.65 
 
 		 534 aa  939    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  48.48 
 
 		 521 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  76.21 
 
 		 229 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  36.8 
 
 		 557 aa  331  3e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  36.38 
 
 		 530 aa  313  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  37.05 
 
 		 565 aa  310  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  34.93 
 
 		 581 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  35.21 
 
 		 546 aa  296  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  34.35 
 
 		 558 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  35.45 
 
 		 602 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  33.09 
 
 		 563 aa  290  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  35.11 
 
 		 562 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  35.11 
 
 		 562 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  33.65 
 
 		 541 aa  290  6e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  34.42 
 
 		 564 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  33.86 
 
 		 581 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  33.93 
 
 		 545 aa  283  7.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  32.88 
 
 		 581 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  34.51 
 
 		 537 aa  281  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  34.64 
 
 		 553 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  33.53 
 
 		 580 aa  281  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  33.33 
 
 		 550 aa  279  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  34.12 
 
 		 537 aa  277  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  35.23 
 
 		 542 aa  277  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  33.27 
 
 		 562 aa  276  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  33.27 
 
 		 562 aa  276  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  35.03 
 
 		 542 aa  276  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  32.61 
 
 		 569 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  30.66 
 
 		 590 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  30.66 
 
 		 590 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  30.66 
 
 		 590 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  32.41 
 
 		 561 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  32.87 
 
 		 562 aa  274  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  32.65 
 
 		 543 aa  273  8.000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  33.4 
 
 		 552 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  35.39 
 
 		 546 aa  271  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  34.4 
 
 		 556 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  34.54 
 
 		 498 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  33.73 
 
 		 574 aa  269  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  34.07 
 
 		 586 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  34.28 
 
 		 561 aa  267  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  32.39 
 
 		 585 aa  266  7e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  34.06 
 
 		 561 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  33.54 
 
 		 564 aa  264  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  32.4 
 
 		 581 aa  263  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  33.33 
 
 		 568 aa  263  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  33.4 
 
 		 566 aa  259  9e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  33.2 
 
 		 535 aa  256  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  32.02 
 
 		 529 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  32.74 
 
 		 510 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  32.78 
 
 		 540 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  32.65 
 
 		 535 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  32.48 
 
 		 573 aa  249  8e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  32.3 
 
 		 540 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  31.76 
 
 		 565 aa  248  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  33.2 
 
 		 583 aa  248  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  32.81 
 
 		 577 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  32.26 
 
 		 565 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  32.05 
 
 		 577 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  33.19 
 
 		 491 aa  240  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  29.09 
 
 		 588 aa  236  7e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  29.09 
 
 		 602 aa  231  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  30.98 
 
 		 574 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  31.78 
 
 		 503 aa  230  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  32.07 
 
 		 572 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  31.46 
 
 		 581 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  31.3 
 
 		 555 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  31.3 
 
 		 579 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  29.31 
 
 		 528 aa  217  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  30.02 
 
 		 563 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  30.02 
 
 		 563 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  29.46 
 
 		 604 aa  213  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.8 
 
 		 590 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.8 
 
 		 562 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.8 
 
 		 591 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  28.06 
 
 		 581 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  28 
 
 		 571 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  31.01 
 
 		 455 aa  179  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  27.7 
 
 		 584 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  32.28 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  27.66 
 
 		 611 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  26.59 
 
 		 606 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  26.55 
 
 		 606 aa  161  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  25.33 
 
 		 629 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  44.05 
 
 		 169 aa  151  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  28.95 
 
 		 556 aa  150  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  27.1 
 
 		 570 aa  144  5e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  24.3 
 
 		 593 aa  140  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  24.21 
 
 		 569 aa  139  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3074  phage terminase  26.1 
 
 		 489 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2607  phage terminase  26.24 
 
 		 558 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  23.58 
 
 		 534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1603  Terminase  25.05 
 
 		 557 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  24.69 
 
 		 569 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  33.95 
 
 		 215 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  24.49 
 
 		 569 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>