144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2497 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  100 
 
 
455 aa  952    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  93.12 
 
 
577 aa  757    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  99.21 
 
 
577 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  69.35 
 
 
574 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  62.94 
 
 
573 aa  503  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  47.38 
 
 
564 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  43.8 
 
 
556 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  42.19 
 
 
581 aa  293  6e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  39.2 
 
 
569 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  38.93 
 
 
561 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  40.92 
 
 
581 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  39.67 
 
 
565 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  36.79 
 
 
585 aa  240  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  31.33 
 
 
568 aa  204  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  33.61 
 
 
557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  31.93 
 
 
534 aa  190  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  31.67 
 
 
535 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  31.93 
 
 
534 aa  189  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  31.48 
 
 
849 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  31.63 
 
 
566 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  29.9 
 
 
564 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  31.01 
 
 
535 aa  179  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  29.67 
 
 
521 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  30.29 
 
 
565 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  29.75 
 
 
574 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  98.73 
 
 
313 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  29.44 
 
 
541 aa  162  9e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0244  hypothetical protein  98.73 
 
 
80 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.201216  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  28.96 
 
 
590 aa  160  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  29.63 
 
 
543 aa  160  4e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  28.96 
 
 
590 aa  160  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  28.96 
 
 
590 aa  160  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  30.77 
 
 
565 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  30.67 
 
 
579 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  28.54 
 
 
629 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  29.74 
 
 
581 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  28.15 
 
 
580 aa  151  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  28.21 
 
 
552 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  27.82 
 
 
571 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  29.38 
 
 
553 aa  143  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  26.85 
 
 
572 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  23.98 
 
 
581 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  26.11 
 
 
604 aa  133  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  25.41 
 
 
558 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  25 
 
 
563 aa  130  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  24.21 
 
 
581 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  26.21 
 
 
583 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  25.19 
 
 
602 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  24.2 
 
 
581 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  28.46 
 
 
586 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  28.04 
 
 
563 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  28.04 
 
 
563 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.84 
 
 
590 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  24.67 
 
 
588 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.84 
 
 
562 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  25.14 
 
 
542 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  27.22 
 
 
546 aa  121  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  28.3 
 
 
561 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.56 
 
 
591 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  25.41 
 
 
546 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  24.34 
 
 
537 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  25.93 
 
 
510 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  28.49 
 
 
561 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  27.35 
 
 
545 aa  117  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  24.34 
 
 
537 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  25.48 
 
 
556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  24.03 
 
 
542 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  26.98 
 
 
562 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  26.98 
 
 
562 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  25.57 
 
 
540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  27.25 
 
 
562 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  25.95 
 
 
584 aa  111  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  26.4 
 
 
530 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  26.32 
 
 
540 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1433  phage O protein family  67.09 
 
 
320 aa  108  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000630558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1259  phage O family protein  65.82 
 
 
315 aa  107  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000280847  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  26.84 
 
 
356 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  26.98 
 
 
562 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  26.98 
 
 
562 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  24.51 
 
 
550 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  27.52 
 
 
229 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  24.01 
 
 
535 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  24.6 
 
 
529 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  26.16 
 
 
498 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  22.51 
 
 
602 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  22.37 
 
 
535 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  32.74 
 
 
169 aa  89.7  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  25.5 
 
 
570 aa  87.8  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  23.5 
 
 
555 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  24.05 
 
 
555 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  25.2 
 
 
534 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2023  phage terminase  21.8 
 
 
553 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  22.04 
 
 
569 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2059  phage terminase  21.8 
 
 
553 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3592  terminase  23.37 
 
 
555 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156762  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  23.25 
 
 
528 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  24.8 
 
 
569 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2276  phage O protein  68.52 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000295472  hitchhiker  0.000000000000106842 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  24.53 
 
 
569 aa  73.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  47.95 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>