112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2960 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  100 
 
 		 555 aa  1141    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  30.72 
 
 		 535 aa  220  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  31.74 
 
 		 849 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  31.3 
 
 		 535 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  30.5 
 
 		 534 aa  205  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  30.5 
 
 		 534 aa  205  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  27.8 
 
 		 521 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  28.7 
 
 		 498 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  27.31 
 
 		 564 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  27.07 
 
 		 581 aa  180  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  27.03 
 
 		 581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  26.36 
 
 		 566 aa  174  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  27.31 
 
 		 558 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  27.16 
 
 		 590 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  27.16 
 
 		 590 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  27.16 
 
 		 590 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  27.81 
 
 		 541 aa  164  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  26.92 
 
 		 529 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  24.61 
 
 		 588 aa  159  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  24.44 
 
 		 530 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  27.86 
 
 		 491 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  25.44 
 
 		 564 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  26.42 
 
 		 543 aa  151  3e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  26.58 
 
 		 579 aa  150  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  25.51 
 
 		 540 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  24.18 
 
 		 552 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  36.77 
 
 		 229 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  25.35 
 
 		 537 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  24.62 
 
 		 542 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  25.61 
 
 		 540 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  26.02 
 
 		 537 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  25.4 
 
 		 545 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  25.24 
 
 		 556 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  26.31 
 
 		 580 aa  145  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  25.38 
 
 		 542 aa  143  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  26.19 
 
 		 557 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  24.4 
 
 		 510 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  26.27 
 
 		 565 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  23.98 
 
 		 535 aa  140  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  25.51 
 
 		 561 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  25.32 
 
 		 569 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  24.52 
 
 		 571 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  24.36 
 
 		 528 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  26.93 
 
 		 503 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  24.15 
 
 		 586 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  25.9 
 
 		 581 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  25.28 
 
 		 561 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  25.05 
 
 		 565 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  24.95 
 
 		 577 aa  133  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  24.95 
 
 		 602 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.15 
 
 		 590 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.15 
 
 		 562 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  26.01 
 
 		 562 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  26.01 
 
 		 562 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  23.6 
 
 		 581 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  24.46 
 
 		 553 aa  128  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.69 
 
 		 591 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  24.91 
 
 		 573 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  25.72 
 
 		 577 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  23.26 
 
 		 604 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  24.95 
 
 		 583 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  26.12 
 
 		 562 aa  127  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  26.12 
 
 		 562 aa  127  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  26.83 
 
 		 572 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  25.67 
 
 		 562 aa  125  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  24.4 
 
 		 563 aa  124  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  24.4 
 
 		 563 aa  124  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  25.28 
 
 		 581 aa  123  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  22.72 
 
 		 535 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  23.53 
 
 		 574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  24.38 
 
 		 550 aa  120  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  24.01 
 
 		 546 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  24.37 
 
 		 565 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  24.52 
 
 		 561 aa  117  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  24.81 
 
 		 568 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  26.08 
 
 		 563 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  23.75 
 
 		 585 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  22.69 
 
 		 581 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  22.94 
 
 		 602 aa  102  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  26.74 
 
 		 356 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  20.93 
 
 		 574 aa  94  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  23.68 
 
 		 546 aa  92  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  22.59 
 
 		 584 aa  87.8  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  23.5 
 
 		 455 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  21.39 
 
 		 611 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  21.34 
 
 		 569 aa  79  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4976  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  22.91 
 
 		 525 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5356  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  22.91 
 
 		 523 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  22.95 
 
 		 606 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  21.97 
 
 		 629 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  22.6 
 
 		 606 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  27.78 
 
 		 169 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1649  Phage terminase-like protein, large subunit  21.09 
 
 		 626 aa  69.7  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2023  phage terminase  21.64 
 
 		 553 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2059  phage terminase  21.64 
 
 		 553 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  23.04 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  20.15 
 
 		 569 aa  57.4  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1538  putative phage terminase, large subunit  19.85 
 
 		 553 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0938  putative phage terminase, large subunit  20.58 
 
 		 553 aa  54.7  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  19.74 
 
 		 593 aa  53.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>