131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2480 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  100 
 
 		 545 aa  1124    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  60.19 
 
 		 540 aa  657    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  59.05 
 
 		 530 aa  630  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  55.72 
 
 		 542 aa  617  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  55.72 
 
 		 542 aa  617  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  55.99 
 
 		 540 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  54.12 
 
 		 537 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  53.93 
 
 		 537 aa  568  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  52.3 
 
 		 535 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  53 
 
 		 561 aa  531  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  53.29 
 
 		 535 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  51.19 
 
 		 510 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  35.74 
 
 		 521 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  33.93 
 
 		 535 aa  272  1e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  33.4 
 
 		 534 aa  266  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  33.4 
 
 		 534 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  32.8 
 
 		 535 aa  259  8e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  32.67 
 
 		 849 aa  240  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  28.85 
 
 		 543 aa  232  1e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  29.02 
 
 		 541 aa  231  3e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  29.02 
 
 		 557 aa  219  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  29.22 
 
 		 528 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  27.88 
 
 		 568 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  26.73 
 
 		 552 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  25.63 
 
 		 590 aa  195  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  25.63 
 
 		 590 aa  195  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  25.63 
 
 		 590 aa  195  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  27.85 
 
 		 556 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  29.3 
 
 		 586 aa  186  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  28.57 
 
 		 564 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  27.88 
 
 		 585 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  27.15 
 
 		 581 aa  184  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  28.8 
 
 		 498 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  27.97 
 
 		 580 aa  181  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  26.43 
 
 		 572 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  26.81 
 
 		 558 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  27.36 
 
 		 565 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  25.9 
 
 		 581 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  27.31 
 
 		 565 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  26.02 
 
 		 546 aa  165  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  28.01 
 
 		 529 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  25.35 
 
 		 579 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  26.97 
 
 		 583 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  23.76 
 
 		 581 aa  163  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  25.14 
 
 		 581 aa  163  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  25.1 
 
 		 569 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  25.1 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  28.06 
 
 		 546 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  25.51 
 
 		 565 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  26.15 
 
 		 566 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  27.89 
 
 		 503 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  26.29 
 
 		 550 aa  154  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  27.29 
 
 		 491 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  25.4 
 
 		 553 aa  152  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  23.78 
 
 		 571 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  25.74 
 
 		 573 aa  150  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  24.35 
 
 		 564 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  25.28 
 
 		 602 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  25.4 
 
 		 555 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  26.72 
 
 		 574 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  24.64 
 
 		 574 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  25 
 
 		 561 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  25.98 
 
 		 577 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  24.65 
 
 		 562 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  25.23 
 
 		 581 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  24.65 
 
 		 562 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  25.68 
 
 		 577 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  23.81 
 
 		 562 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  24.08 
 
 		 588 aa  133  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  23.81 
 
 		 562 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  26.59 
 
 		 569 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  24.58 
 
 		 563 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  26.33 
 
 		 556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  26.49 
 
 		 569 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  24.1 
 
 		 562 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  25.8 
 
 		 581 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.2 
 
 		 590 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.21 
 
 		 562 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  24.58 
 
 		 604 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  25.24 
 
 		 611 aa  127  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  25.14 
 
 		 606 aa  126  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  25.14 
 
 		 606 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  22.2 
 
 		 563 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  22.2 
 
 		 563 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23 
 
 		 591 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  34.23 
 
 		 229 aa  124  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  23.19 
 
 		 584 aa  120  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1603  Terminase  24.3 
 
 		 557 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  27.35 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  23.35 
 
 		 629 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  23.48 
 
 		 593 aa  108  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  21.75 
 
 		 602 aa  104  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  21.7 
 
 		 569 aa  102  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0359  phage terminase  26.09 
 
 		 573 aa  95.9  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0988  phage terminase  26.23 
 
 		 573 aa  95.5  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1750  phage terminase  25.59 
 
 		 570 aa  90.9  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  20.31 
 
 		 534 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  31.97 
 
 		 169 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0238  phage terminase  22.78 
 
 		 573 aa  85.5  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2607  phage terminase  20.35 
 
 		 558 aa  84  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>