125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2967 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  100 
 
 		 581 aa  1211    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  59.22 
 
 		 581 aa  679    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  73.69 
 
 		 558 aa  860    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  94.32 
 
 		 581 aa  1146    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  55.08 
 
 		 602 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  53.22 
 
 		 550 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  50.09 
 
 		 563 aa  533  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  48.11 
 
 		 583 aa  528  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  49.12 
 
 		 604 aa  505  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  46.96 
 
 		 588 aa  500  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  43.78 
 
 		 602 aa  489  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  35.45 
 
 		 593 aa  355  1e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  36.53 
 
 		 606 aa  339  8e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  36.53 
 
 		 606 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  34.28 
 
 		 557 aa  333  5e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  36.49 
 
 		 611 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  34.23 
 
 		 552 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  35.99 
 
 		 521 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  34.93 
 
 		 535 aa  292  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  31.19 
 
 		 556 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  33.39 
 
 		 565 aa  286  9e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  32.62 
 
 		 581 aa  278  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  35.87 
 
 		 534 aa  274  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  36.91 
 
 		 849 aa  274  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  33.86 
 
 		 535 aa  273  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  35.67 
 
 		 534 aa  273  7e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  30.81 
 
 		 564 aa  264  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  31.76 
 
 		 568 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  31.67 
 
 		 585 aa  252  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  29.6 
 
 		 553 aa  244  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  27.91 
 
 		 590 aa  243  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  27.91 
 
 		 590 aa  243  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  27.91 
 
 		 590 aa  243  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  31.42 
 
 		 565 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  32.29 
 
 		 546 aa  241  2e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  30.52 
 
 		 562 aa  226  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  30.52 
 
 		 562 aa  226  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  30.36 
 
 		 562 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  32.01 
 
 		 498 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  29.72 
 
 		 541 aa  223  6e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  28.77 
 
 		 574 aa  223  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  30.78 
 
 		 562 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  30.78 
 
 		 562 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  28.35 
 
 		 569 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  27.93 
 
 		 564 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  27.99 
 
 		 561 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  29.08 
 
 		 543 aa  219  1e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  28.07 
 
 		 566 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  29.22 
 
 		 573 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  31.17 
 
 		 571 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  28.69 
 
 		 581 aa  217  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  27.48 
 
 		 579 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.19 
 
 		 562 aa  213  9e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.19 
 
 		 590 aa  213  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  30.22 
 
 		 561 aa  213  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  26.62 
 
 		 577 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.19 
 
 		 591 aa  213  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  29.18 
 
 		 529 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  27.37 
 
 		 577 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  28.28 
 
 		 580 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  28.06 
 
 		 574 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  28.96 
 
 		 572 aa  204  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  27.72 
 
 		 581 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  27.49 
 
 		 530 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  29.68 
 
 		 510 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  27.12 
 
 		 586 aa  191  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  30.17 
 
 		 491 aa  189  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  28.19 
 
 		 563 aa  188  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  28.19 
 
 		 563 aa  188  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  27.27 
 
 		 528 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  26.7 
 
 		 565 aa  183  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  28.27 
 
 		 537 aa  183  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  28.27 
 
 		 537 aa  182  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  27.18 
 
 		 503 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  27.03 
 
 		 555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  28.81 
 
 		 546 aa  171  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  26.29 
 
 		 542 aa  171  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  27.18 
 
 		 535 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  26.1 
 
 		 542 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  25.96 
 
 		 540 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  25.14 
 
 		 545 aa  163  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  27.43 
 
 		 561 aa  160  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  56.94 
 
 		 163 aa  160  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  26.02 
 
 		 540 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  26.79 
 
 		 535 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  24.77 
 
 		 584 aa  148  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  23.49 
 
 		 569 aa  137  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  26.54 
 
 		 556 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  24.2 
 
 		 455 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  28.53 
 
 		 356 aa  124  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  23.6 
 
 		 534 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  34.07 
 
 		 229 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1376  putative phage terminase, large subunit  21.79 
 
 		 555 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0389174 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  24.32 
 
 		 570 aa  105  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  33.5 
 
 		 215 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  22.22 
 
 		 555 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3592  terminase  21.17 
 
 		 555 aa  101  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156762  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  21.53 
 
 		 629 aa  100  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2153  phage terminase  25.54 
 
 		 504 aa  93.2  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.503371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2023  phage terminase  20.65 
 
 		 553 aa  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>