99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2063 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  57.52 
 
 		 581 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  56.94 
 
 		 581 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  50 
 
 		 602 aa  156  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  54.74 
 
 		 558 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  53.47 
 
 		 581 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  52.78 
 
 		 564 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  52.82 
 
 		 552 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  56.25 
 
 		 583 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  51.47 
 
 		 568 aa  141  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  54.48 
 
 		 550 aa  140  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  47.5 
 
 		 585 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  48.2 
 
 		 557 aa  139  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  53.73 
 
 		 602 aa  138  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  51.03 
 
 		 581 aa  133  8e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  55.28 
 
 		 563 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  50 
 
 		 588 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  48.25 
 
 		 577 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  50.34 
 
 		 565 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  46.85 
 
 		 556 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  46.85 
 
 		 577 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  45.52 
 
 		 565 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  46.85 
 
 		 573 aa  126  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  42.25 
 
 		 574 aa  123  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  42.68 
 
 		 606 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  42.68 
 
 		 606 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  55.75 
 
 		 521 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  44.76 
 
 		 593 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  47.22 
 
 		 581 aa  121  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  51.02 
 
 		 604 aa  121  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  40.28 
 
 		 572 aa  118  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  44.76 
 
 		 574 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  45.45 
 
 		 569 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  45.45 
 
 		 561 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  43.75 
 
 		 581 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  40.13 
 
 		 591 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  37.24 
 
 		 590 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  37.24 
 
 		 590 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  37.24 
 
 		 590 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  40.13 
 
 		 562 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  40.13 
 
 		 590 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  40.82 
 
 		 562 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  40.82 
 
 		 562 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  39.58 
 
 		 562 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  39.58 
 
 		 562 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  40 
 
 		 562 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  39.58 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  39.33 
 
 		 563 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  39.33 
 
 		 563 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  37.76 
 
 		 579 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  41.1 
 
 		 546 aa  105  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  40 
 
 		 611 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  35.57 
 
 		 561 aa  100  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  40.97 
 
 		 571 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  37.76 
 
 		 566 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  38.03 
 
 		 553 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  42.28 
 
 		 535 aa  91.3  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  42.97 
 
 		 586 aa  91.3  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  48.04 
 
 		 534 aa  90.5  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  48.04 
 
 		 534 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  34.97 
 
 		 564 aa  87.4  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  40.34 
 
 		 535 aa  84.3  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  48.35 
 
 		 546 aa  81.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  39.22 
 
 		 543 aa  81.6  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  32.87 
 
 		 569 aa  80.9  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  38.24 
 
 		 541 aa  77.4  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  44.29 
 
 		 849 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  34.03 
 
 		 565 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1652  hypothetical protein  46.15 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1117  phage terminase  31.03 
 
 		 629 aa  72.8  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2261  hypothetical protein  47.14 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.051651  normal  0.80364 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  34.02 
 
 		 535 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  34.74 
 
 		 540 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1649  Phage terminase-like protein, large subunit  28 
 
 		 626 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  37.21 
 
 		 584 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  33.96 
 
 		 556 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  32.32 
 
 		 530 aa  58.2  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5356  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  31.08 
 
 		 523 aa  57.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4976  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  31.08 
 
 		 525 aa  57.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  31.96 
 
 		 535 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  30.53 
 
 		 545 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  32.63 
 
 		 542 aa  54.7  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  35.56 
 
 		 529 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  32.63 
 
 		 542 aa  54.3  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2633  phage terminase  32.69 
 
 		 544 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  30.47 
 
 		 580 aa  52.4  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  30.93 
 
 		 537 aa  52  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  31.72 
 
 		 629 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  29.9 
 
 		 537 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  50.91 
 
 		 491 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0213  Phage terminase-like protein large subunit  32.08 
 
 		 551 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  35.71 
 
 		 498 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2958  phage terminase  39.77 
 
 		 489 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2914  phage terminase  39.77 
 
 		 489 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  32.98 
 
 		 510 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2153  phage terminase  33.33 
 
 		 504 aa  45.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.503371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  27.37 
 
 		 561 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5068  Terminase  34.95 
 
 		 566 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4081  Terminase  34.95 
 
 		 566 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>