83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1649 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1649  Phage terminase-like protein, large subunit  100 
 
 
626 aa  1295    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1117  phage terminase  37.02 
 
 
629 aa  403  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  27.07 
 
 
569 aa  191  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  26.82 
 
 
571 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  25.08 
 
 
581 aa  146  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  25.69 
 
 
566 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.8 
 
 
562 aa  124  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.8 
 
 
590 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  24.44 
 
 
572 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  23.49 
 
 
564 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.63 
 
 
591 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  25.76 
 
 
565 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  24.86 
 
 
541 aa  107  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  24.18 
 
 
553 aa  105  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  22.84 
 
 
552 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  21.97 
 
 
565 aa  98.2  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  23.55 
 
 
556 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  22.84 
 
 
581 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  22.8 
 
 
565 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  24.67 
 
 
543 aa  95.5  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  22.88 
 
 
564 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  24.1 
 
 
590 aa  91.7  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  24.1 
 
 
590 aa  91.7  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  24.1 
 
 
590 aa  91.7  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  25.41 
 
 
563 aa  89.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  25.41 
 
 
563 aa  89.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  22.73 
 
 
579 aa  89  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  23.16 
 
 
569 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  23 
 
 
581 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  22.84 
 
 
561 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  24.12 
 
 
581 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  24.07 
 
 
574 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  22.61 
 
 
581 aa  82.8  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  23.87 
 
 
535 aa  80.5  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  23.69 
 
 
498 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  24.7 
 
 
573 aa  76.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5356  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  22.66 
 
 
523 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  22.86 
 
 
562 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4976  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  22.66 
 
 
525 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  22.86 
 
 
562 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  20.59 
 
 
588 aa  74.7  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  22.54 
 
 
562 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  22.13 
 
 
558 aa  75.1  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  22.98 
 
 
577 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  25.39 
 
 
535 aa  71.2  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  22.33 
 
 
561 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  21.59 
 
 
606 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  23.38 
 
 
577 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  21.23 
 
 
529 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  21.09 
 
 
555 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  23.29 
 
 
562 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  23.29 
 
 
562 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  21.02 
 
 
602 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  21.78 
 
 
586 aa  67.8  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  22.52 
 
 
557 aa  67.8  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  22.54 
 
 
550 aa  66.6  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  22.71 
 
 
534 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  21.22 
 
 
602 aa  66.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  22.51 
 
 
534 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  21.38 
 
 
606 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  25.83 
 
 
849 aa  63.9  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  21.77 
 
 
568 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  20.35 
 
 
510 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  22.89 
 
 
581 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  20.73 
 
 
546 aa  61.6  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  21.54 
 
 
593 aa  60.5  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  28 
 
 
163 aa  59.3  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  20.1 
 
 
583 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  20.9 
 
 
540 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  22.69 
 
 
356 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  21.06 
 
 
574 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  20.68 
 
 
611 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  20.51 
 
 
556 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  23.21 
 
 
491 aa  50.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  20.87 
 
 
555 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  26.24 
 
 
229 aa  49.7  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  23.34 
 
 
528 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  20.72 
 
 
563 aa  48.1  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  21.02 
 
 
521 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3592  terminase  20.79 
 
 
555 aa  47.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156762  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  24.36 
 
 
584 aa  47.4  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  21.2 
 
 
585 aa  45.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  21.08 
 
 
530 aa  44.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>