85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1117 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1117  phage terminase  100 
 
 		 629 aa  1311    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1649  Phage terminase-like protein, large subunit  37.02 
 
 		 626 aa  403  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  27.07 
 
 		 569 aa  224  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  25.39 
 
 		 581 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  24.17 
 
 		 572 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  25.86 
 
 		 565 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  24.56 
 
 		 564 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  25.09 
 
 		 571 aa  136  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  24.32 
 
 		 566 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  24.82 
 
 		 565 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  23.89 
 
 		 552 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  23.92 
 
 		 579 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  24.13 
 
 		 591 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.95 
 
 		 590 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  22.71 
 
 		 553 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.68 
 
 		 562 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  22.45 
 
 		 577 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  23.06 
 
 		 569 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  22.51 
 
 		 556 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  23.85 
 
 		 565 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  23.29 
 
 		 561 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  24.89 
 
 		 564 aa  104  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  22.41 
 
 		 577 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  23.94 
 
 		 581 aa  101  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  20.68 
 
 		 586 aa  97.1  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  23.3 
 
 		 590 aa  97.1  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  23.3 
 
 		 590 aa  97.1  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  23.3 
 
 		 590 aa  97.1  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  23.13 
 
 		 541 aa  95.5  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  22.93 
 
 		 574 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  21.72 
 
 		 573 aa  92.8  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  24.04 
 
 		 563 aa  91.3  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  24.04 
 
 		 563 aa  91.3  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  22.04 
 
 		 581 aa  87.8  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  20.71 
 
 		 585 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  21.28 
 
 		 535 aa  87.4  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4976  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  22.73 
 
 		 525 aa  87  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5356  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  22.73 
 
 		 523 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  21.27 
 
 		 574 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  21.37 
 
 		 550 aa  84.7  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  20.73 
 
 		 543 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  21.43 
 
 		 534 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  22.26 
 
 		 561 aa  82  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  21.43 
 
 		 534 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  23.15 
 
 		 558 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  21.61 
 
 		 593 aa  80.9  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  22.28 
 
 		 568 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  22.82 
 
 		 557 aa  80.1  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  22.98 
 
 		 562 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  22.98 
 
 		 562 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  21.26 
 
 		 535 aa  75.1  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  31.03 
 
 		 163 aa  72.8  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  21.96 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  23.29 
 
 		 562 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  23.29 
 
 		 562 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  24.23 
 
 		 849 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  21.66 
 
 		 602 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  20.96 
 
 		 583 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  22 
 
 		 581 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  21.51 
 
 		 581 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  23.08 
 
 		 562 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  25.85 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  25.2 
 
 		 581 aa  64.3  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  21.44 
 
 		 588 aa  64.3  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  22.33 
 
 		 546 aa  62.4  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  26.53 
 
 		 606 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  20.23 
 
 		 602 aa  62  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  26.53 
 
 		 606 aa  62  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  19.5 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  18.91 
 
 		 580 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  24.91 
 
 		 356 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  20.49 
 
 		 540 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2607  phage terminase  24.19 
 
 		 558 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  27.27 
 
 		 611 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  20.37 
 
 		 530 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  20.37 
 
 		 584 aa  50.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  22.41 
 
 		 534 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  22.3 
 
 		 570 aa  47  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  21.78 
 
 		 455 aa  47  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  30 
 
 		 604 aa  46.2  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  20.66 
 
 		 529 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  24.34 
 
 		 629 aa  45.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  24.89 
 
 		 555 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  20.55 
 
 		 556 aa  43.9  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  20 
 
 		 555 aa  43.9  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>