119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1587 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  100 
 
 		 579 aa  1207    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  47.5 
 
 		 572 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  41.09 
 
 		 564 aa  420  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  41.59 
 
 		 566 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  37.95 
 
 		 571 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  40.93 
 
 		 565 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  35.06 
 
 		 581 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  33.69 
 
 		 565 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  29.36 
 
 		 590 aa  272  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  29.36 
 
 		 590 aa  272  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  29.36 
 
 		 590 aa  272  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  30.74 
 
 		 556 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  31.25 
 
 		 553 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  30.35 
 
 		 562 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  30.35 
 
 		 590 aa  256  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  31.15 
 
 		 581 aa  256  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  30.35 
 
 		 591 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  31.24 
 
 		 585 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  30.44 
 
 		 577 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  28.14 
 
 		 569 aa  237  5.0000000000000005e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  30.39 
 
 		 577 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  28.82 
 
 		 581 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  28.39 
 
 		 564 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  30.37 
 
 		 557 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  29.31 
 
 		 574 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  28.9 
 
 		 573 aa  228  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  30.18 
 
 		 568 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  29.96 
 
 		 521 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  30.19 
 
 		 563 aa  217  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  30.19 
 
 		 563 aa  217  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  27.48 
 
 		 581 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  31.3 
 
 		 535 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  30 
 
 		 534 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  27.48 
 
 		 581 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  29.8 
 
 		 534 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  30.69 
 
 		 541 aa  211  3e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  28 
 
 		 546 aa  209  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  30.66 
 
 		 535 aa  206  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  27.32 
 
 		 558 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  27.96 
 
 		 565 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  29.47 
 
 		 583 aa  203  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  28.14 
 
 		 602 aa  203  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  27.77 
 
 		 569 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  27.4 
 
 		 561 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  30.91 
 
 		 849 aa  196  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  28.44 
 
 		 550 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  26.81 
 
 		 563 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  28.34 
 
 		 586 aa  192  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  28.28 
 
 		 543 aa  190  5e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  27.29 
 
 		 581 aa  190  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  27.09 
 
 		 552 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  26.63 
 
 		 574 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  25.95 
 
 		 604 aa  181  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  28.48 
 
 		 588 aa  179  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  25.51 
 
 		 530 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  28.12 
 
 		 602 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  28.06 
 
 		 562 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  28.06 
 
 		 562 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  26.98 
 
 		 562 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  26.98 
 
 		 562 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  26.44 
 
 		 510 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  26.91 
 
 		 562 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  26.86 
 
 		 561 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  25.35 
 
 		 545 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  30.67 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  24.55 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  26.97 
 
 		 546 aa  154  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  22.72 
 
 		 593 aa  152  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  26.44 
 
 		 584 aa  152  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  26.58 
 
 		 555 aa  150  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  24.02 
 
 		 542 aa  146  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  23.94 
 
 		 540 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  24.02 
 
 		 542 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  23.43 
 
 		 537 aa  140  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  23.43 
 
 		 537 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  26.35 
 
 		 556 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  24.31 
 
 		 561 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  22.35 
 
 		 606 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  26.71 
 
 		 491 aa  133  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  22.73 
 
 		 611 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  22.09 
 
 		 606 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1117  phage terminase  23.92 
 
 		 629 aa  125  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  24.51 
 
 		 498 aa  123  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  22.54 
 
 		 535 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  23.45 
 
 		 535 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  23.16 
 
 		 580 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  25.44 
 
 		 529 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  24.28 
 
 		 629 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  27.31 
 
 		 229 aa  110  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  37.76 
 
 		 163 aa  106  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  24.65 
 
 		 528 aa  97.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2607  phage terminase  26.64 
 
 		 558 aa  95.1  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  26.02 
 
 		 356 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  23.05 
 
 		 503 aa  91.3  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1649  Phage terminase-like protein, large subunit  22.73 
 
 		 626 aa  89  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4976  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  24.45 
 
 		 525 aa  87  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5356  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  24.7 
 
 		 523 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  28.23 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  24.95 
 
 		 534 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2023  phage terminase  22.86 
 
 		 553 aa  76.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>