118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0645 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  100 
 
 		 583 aa  1187    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  48.98 
 
 		 602 aa  547  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  48.11 
 
 		 581 aa  543  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  47.77 
 
 		 581 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  48.74 
 
 		 558 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  50 
 
 		 604 aa  517  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  45.33 
 
 		 581 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  42.64 
 
 		 588 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  41.47 
 
 		 602 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  43.53 
 
 		 550 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  39.25 
 
 		 563 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  33.44 
 
 		 593 aa  292  9e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  34.31 
 
 		 557 aa  288  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  32.12 
 
 		 556 aa  280  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  35.8 
 
 		 552 aa  280  7e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  35.36 
 
 		 521 aa  267  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  33.28 
 
 		 568 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  33.21 
 
 		 564 aa  262  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  32.64 
 
 		 535 aa  261  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  33.72 
 
 		 606 aa  259  9e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  33.5 
 
 		 606 aa  259  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  34.32 
 
 		 611 aa  256  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  28.72 
 
 		 590 aa  256  8e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  28.72 
 
 		 590 aa  256  8e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  28.72 
 
 		 590 aa  256  8e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  31.33 
 
 		 581 aa  254  3e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  33.2 
 
 		 535 aa  251  2e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  32.26 
 
 		 534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  32.08 
 
 		 534 aa  244  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  31.95 
 
 		 565 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  31.14 
 
 		 585 aa  237  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  30.91 
 
 		 565 aa  236  9e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  32.2 
 
 		 849 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  27.84 
 
 		 572 aa  233  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  31.58 
 
 		 574 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  29.66 
 
 		 581 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  29.08 
 
 		 574 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  29.96 
 
 		 571 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  29.68 
 
 		 573 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  25.53 
 
 		 564 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  27.16 
 
 		 566 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  29.47 
 
 		 579 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  28.92 
 
 		 553 aa  209  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  29.35 
 
 		 577 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  28.99 
 
 		 577 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  28.98 
 
 		 562 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  28.98 
 
 		 562 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  30.15 
 
 		 529 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  26.98 
 
 		 541 aa  196  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  30.83 
 
 		 546 aa  195  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  28.9 
 
 		 565 aa  193  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  28.36 
 
 		 562 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  28.36 
 
 		 562 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  25.83 
 
 		 543 aa  189  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  28.1 
 
 		 562 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  28.64 
 
 		 586 aa  188  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  27.67 
 
 		 561 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  28.46 
 
 		 561 aa  187  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  27.67 
 
 		 569 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.45 
 
 		 590 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.45 
 
 		 562 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  28.01 
 
 		 530 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.45 
 
 		 591 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  30.44 
 
 		 581 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  29.98 
 
 		 498 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  26.97 
 
 		 545 aa  177  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  30 
 
 		 510 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  29.25 
 
 		 537 aa  173  9e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  28.85 
 
 		 537 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  27.3 
 
 		 563 aa  168  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  27.3 
 
 		 563 aa  168  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  28.46 
 
 		 491 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  25.83 
 
 		 584 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  26.46 
 
 		 580 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  56.25 
 
 		 163 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  27.65 
 
 		 503 aa  158  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  27.98 
 
 		 540 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  27.55 
 
 		 528 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  26.54 
 
 		 535 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  26.2 
 
 		 542 aa  152  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  26.54 
 
 		 535 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  25.81 
 
 		 542 aa  146  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  24.7 
 
 		 569 aa  138  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  27.91 
 
 		 546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  25.57 
 
 		 561 aa  134  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  25.35 
 
 		 555 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  26.21 
 
 		 455 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  25.15 
 
 		 629 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  25.44 
 
 		 540 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  26.62 
 
 		 556 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  33.16 
 
 		 215 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  31.3 
 
 		 229 aa  96.3  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2702  putative phage terminase, large subunit  21.74 
 
 		 551 aa  87  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  21.54 
 
 		 555 aa  87  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  24.25 
 
 		 356 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  21.34 
 
 		 534 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3592  terminase  20.64 
 
 		 555 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156762  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  30.57 
 
 		 169 aa  82  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1376  putative phage terminase, large subunit  20.99 
 
 		 555 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0389174 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2023  phage terminase  20.87 
 
 		 553 aa  78.2  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>