114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1967 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  100 
 
 		 604 aa  1254    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  52.98 
 
 		 588 aa  588  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  49.12 
 
 		 581 aa  522  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  50 
 
 		 583 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  48.04 
 
 		 558 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  48.42 
 
 		 581 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  44.74 
 
 		 581 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  43.43 
 
 		 602 aa  457  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  42.81 
 
 		 602 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  41.89 
 
 		 550 aa  408  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  38.54 
 
 		 563 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  34 
 
 		 593 aa  319  7.999999999999999e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  35.33 
 
 		 606 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  35.17 
 
 		 606 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  36.17 
 
 		 611 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  30.03 
 
 		 564 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  28.47 
 
 		 557 aa  241  4e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  29.63 
 
 		 556 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  30.05 
 
 		 574 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  31.93 
 
 		 552 aa  224  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  30.47 
 
 		 521 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  28.5 
 
 		 565 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  30.42 
 
 		 849 aa  218  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  29.29 
 
 		 535 aa  217  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  29.46 
 
 		 535 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  29.74 
 
 		 534 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  30.39 
 
 		 534 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  28.42 
 
 		 581 aa  213  7.999999999999999e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  27.85 
 
 		 577 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  28.28 
 
 		 577 aa  208  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  28.27 
 
 		 573 aa  207  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  28.45 
 
 		 546 aa  199  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  26.08 
 
 		 566 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  27.84 
 
 		 581 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  27.38 
 
 		 585 aa  192  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  25.95 
 
 		 579 aa  191  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  28.41 
 
 		 561 aa  191  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  29.41 
 
 		 565 aa  190  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  25.48 
 
 		 564 aa  189  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  27.71 
 
 		 571 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  27.72 
 
 		 568 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  27.29 
 
 		 562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  27.99 
 
 		 529 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  27.29 
 
 		 562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  26.85 
 
 		 574 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  26.92 
 
 		 562 aa  179  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  27.21 
 
 		 572 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.8 
 
 		 591 aa  177  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  30.77 
 
 		 498 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.62 
 
 		 562 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.62 
 
 		 590 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  31.72 
 
 		 581 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  25.74 
 
 		 590 aa  173  9e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  25.74 
 
 		 590 aa  173  9e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  25.74 
 
 		 590 aa  173  9e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  24.65 
 
 		 569 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  26.9 
 
 		 553 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  25.17 
 
 		 562 aa  164  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  25.17 
 
 		 562 aa  164  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  26.75 
 
 		 563 aa  163  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  26.75 
 
 		 563 aa  163  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  24.3 
 
 		 561 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  25.75 
 
 		 586 aa  157  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  27.16 
 
 		 491 aa  153  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  24.47 
 
 		 541 aa  152  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  25.13 
 
 		 565 aa  150  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  26.82 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  24.24 
 
 		 580 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  25.45 
 
 		 530 aa  146  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  25 
 
 		 537 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  25.05 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  25.87 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  24.58 
 
 		 545 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  24.82 
 
 		 537 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  23.56 
 
 		 503 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  26.57 
 
 		 540 aa  136  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  23.09 
 
 		 543 aa  135  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  51.37 
 
 		 163 aa  134  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  26.11 
 
 		 455 aa  133  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  23.26 
 
 		 555 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  24.26 
 
 		 542 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  23.89 
 
 		 542 aa  126  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  26.07 
 
 		 528 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  27.39 
 
 		 546 aa  124  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  22.66 
 
 		 569 aa  123  8e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  28.53 
 
 		 556 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  24.9 
 
 		 540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  24 
 
 		 561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  23.92 
 
 		 584 aa  106  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  26.75 
 
 		 356 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  27.53 
 
 		 229 aa  93.6  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  23.13 
 
 		 534 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  20.63 
 
 		 555 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  22.4 
 
 		 629 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  27.78 
 
 		 215 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3592  terminase  20.37 
 
 		 555 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4976  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  22.09 
 
 		 525 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5356  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  22.09 
 
 		 523 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2023  phage terminase  20.62 
 
 		 553 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2059  phage terminase  20.62 
 
 		 553 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>