88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2059 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2023  phage terminase  100 
 
 
553 aa  1136    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2059  phage terminase  100 
 
 
553 aa  1136    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3592  terminase  53.56 
 
 
555 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1376  putative phage terminase, large subunit  54.38 
 
 
555 aa  596  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0389174 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2702  putative phage terminase, large subunit  51.8 
 
 
551 aa  597  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  53.28 
 
 
555 aa  586  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  41.01 
 
 
534 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2607  phage terminase  36.57 
 
 
558 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  29.75 
 
 
562 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  29.75 
 
 
590 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  29.55 
 
 
591 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  27.38 
 
 
563 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  27.38 
 
 
563 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  25.31 
 
 
565 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  23.38 
 
 
581 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  22.2 
 
 
546 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  23.51 
 
 
581 aa  114  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  23.6 
 
 
570 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  22.87 
 
 
568 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  23.94 
 
 
590 aa  109  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  23.94 
 
 
590 aa  109  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  23.94 
 
 
590 aa  109  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  23.75 
 
 
572 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  23.97 
 
 
564 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  22.98 
 
 
566 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  24.56 
 
 
569 aa  104  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  22.59 
 
 
553 aa  103  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  23.21 
 
 
562 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  22.82 
 
 
562 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  22.82 
 
 
562 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  21.49 
 
 
558 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  21.87 
 
 
586 aa  95.1  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  22.65 
 
 
541 aa  94  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  22.38 
 
 
562 aa  93.6  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  22.38 
 
 
562 aa  93.6  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  22.73 
 
 
561 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  20.65 
 
 
581 aa  89.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  22.29 
 
 
577 aa  87.4  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  22.22 
 
 
577 aa  87.4  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  22.96 
 
 
535 aa  87.4  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  23.45 
 
 
849 aa  87  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  20.08 
 
 
581 aa  87  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  22.54 
 
 
556 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  22.07 
 
 
535 aa  85.9  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  22.98 
 
 
565 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  21.8 
 
 
455 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  22.24 
 
 
534 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  20.63 
 
 
543 aa  80.5  0.00000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  21.07 
 
 
521 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  21.86 
 
 
534 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  23.18 
 
 
585 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  22.42 
 
 
556 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  22.27 
 
 
557 aa  78.2  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  23.69 
 
 
571 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  21.78 
 
 
564 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  22.86 
 
 
579 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  21.56 
 
 
602 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  21.05 
 
 
569 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  19.23 
 
 
588 aa  76.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  21.05 
 
 
561 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  22.97 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  20.74 
 
 
583 aa  73.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  22.82 
 
 
529 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  21.7 
 
 
552 aa  71.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  22.92 
 
 
573 aa  71.6  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  21.79 
 
 
574 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  21.88 
 
 
629 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  24.14 
 
 
581 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  18.48 
 
 
542 aa  67.4  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  21.43 
 
 
563 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  17.66 
 
 
542 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  20.39 
 
 
604 aa  63.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  20.79 
 
 
561 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  18.1 
 
 
580 aa  62.4  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  19.67 
 
 
510 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  24.38 
 
 
581 aa  61.6  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  21.44 
 
 
565 aa  60.5  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  17.74 
 
 
574 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  24.59 
 
 
602 aa  60.1  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  24.37 
 
 
229 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  21.64 
 
 
555 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  17.19 
 
 
530 aa  53.9  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  21.38 
 
 
491 aa  53.5  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  18.61 
 
 
540 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  27.82 
 
 
169 aa  52.8  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  18.34 
 
 
540 aa  50.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  19.88 
 
 
550 aa  50.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  17.55 
 
 
537 aa  45.8  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>