110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0149 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  100 
 
 
229 aa  478  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  78.26 
 
 
534 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  75.98 
 
 
849 aa  378  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  77.83 
 
 
534 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  76.21 
 
 
535 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  74.89 
 
 
535 aa  360  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  51.77 
 
 
521 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  42.08 
 
 
537 aa  174  8e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  42.08 
 
 
537 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  37.22 
 
 
564 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  37.74 
 
 
566 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  43.9 
 
 
498 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  35.59 
 
 
590 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  35.59 
 
 
590 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  35.59 
 
 
590 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  33.33 
 
 
557 aa  152  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  38.26 
 
 
602 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  34.87 
 
 
563 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  40.31 
 
 
530 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  38.97 
 
 
552 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  36.77 
 
 
555 aa  148  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  41 
 
 
503 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  38.43 
 
 
529 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  40.31 
 
 
561 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  41.07 
 
 
169 aa  142  5e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  37.14 
 
 
565 aa  141  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  38.54 
 
 
586 aa  141  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  36.19 
 
 
564 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  36.54 
 
 
550 aa  135  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  34.98 
 
 
491 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  34.01 
 
 
565 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  34.8 
 
 
580 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  32.52 
 
 
561 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  36.79 
 
 
541 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  36.11 
 
 
562 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  36.11 
 
 
562 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  37.37 
 
 
535 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  32.52 
 
 
569 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  35.65 
 
 
356 aa  128  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  36.36 
 
 
535 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  38.34 
 
 
562 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  38.34 
 
 
562 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  35.65 
 
 
562 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  35.41 
 
 
543 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  36.28 
 
 
558 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  33.65 
 
 
528 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  36.89 
 
 
553 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  34.43 
 
 
542 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  33.33 
 
 
542 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  34.35 
 
 
510 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  34.23 
 
 
545 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  36.9 
 
 
561 aa  122  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  31.47 
 
 
581 aa  121  8e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  32.74 
 
 
581 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  34.07 
 
 
581 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  35.11 
 
 
540 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  30.09 
 
 
574 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  36.84 
 
 
546 aa  113  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  33.03 
 
 
585 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  31.28 
 
 
556 aa  111  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  32.43 
 
 
540 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  27.31 
 
 
579 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  31.78 
 
 
574 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  30.52 
 
 
563 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  30.52 
 
 
563 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.28 
 
 
590 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.28 
 
 
562 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  29.82 
 
 
572 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  29.72 
 
 
571 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.28 
 
 
591 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  29.21 
 
 
573 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  28.15 
 
 
581 aa  99.8  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  32.89 
 
 
581 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  28.37 
 
 
577 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  29.36 
 
 
581 aa  98.6  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  30.28 
 
 
611 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  32.47 
 
 
546 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  31.3 
 
 
583 aa  95.9  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  27.52 
 
 
455 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  26.85 
 
 
588 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  27.44 
 
 
577 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  29.66 
 
 
606 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  27.53 
 
 
604 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  29.66 
 
 
606 aa  92  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  30.37 
 
 
565 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  27.44 
 
 
602 aa  88.6  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  28.89 
 
 
568 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  29.49 
 
 
584 aa  76.6  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  26.43 
 
 
629 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0717  phage terminase, large subunit, putative  60.34 
 
 
58 aa  70.5  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  25.78 
 
 
593 aa  65.5  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  24.39 
 
 
569 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1117  phage terminase  25.85 
 
 
629 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  26.2 
 
 
570 aa  58.9  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2023  phage terminase  24.37 
 
 
553 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2059  phage terminase  24.37 
 
 
553 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  26.73 
 
 
556 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3074  phage terminase  27.19 
 
 
489 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218281  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2702  putative phage terminase, large subunit  26.37 
 
 
551 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2607  phage terminase  27.88 
 
 
558 aa  52  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>