82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3074 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3893  Terminase  71.17 
 
 		 489 aa  690    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3074  phage terminase  100 
 
 		 489 aa  1002    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2958  phage terminase  69.51 
 
 		 489 aa  677    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2914  phage terminase  69.51 
 
 		 489 aa  677    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  29.08 
 
 		 557 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  27.61 
 
 		 529 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  26.2 
 
 		 521 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  26.1 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  27.18 
 
 		 498 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  27.51 
 
 		 534 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  27.51 
 
 		 534 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  24.71 
 
 		 849 aa  99.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  24.62 
 
 		 542 aa  93.2  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  27.25 
 
 		 491 aa  92.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  27.54 
 
 		 528 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  24.9 
 
 		 542 aa  90.9  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  24.66 
 
 		 535 aa  88.2  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  25.41 
 
 		 503 aa  87  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  26.16 
 
 		 510 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  25.43 
 
 		 540 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  23.14 
 
 		 581 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  25.2 
 
 		 530 aa  77.4  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  25.87 
 
 		 540 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  21.48 
 
 		 565 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  24.21 
 
 		 564 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  21.93 
 
 		 541 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  21.83 
 
 		 543 aa  74.3  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  26.88 
 
 		 562 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  26.88 
 
 		 562 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  23.24 
 
 		 569 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  24.45 
 
 		 586 aa  71.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  27.95 
 
 		 546 aa  70.9  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  24.62 
 
 		 585 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  22.8 
 
 		 561 aa  67.4  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  22.07 
 
 		 566 aa  67  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4221  Terminase  27.23 
 
 		 526 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.329871  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  24.14 
 
 		 552 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  22.94 
 
 		 550 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  22.79 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  23.02 
 
 		 558 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  20.98 
 
 		 564 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  22.9 
 
 		 574 aa  63.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  30.39 
 
 		 546 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  22.71 
 
 		 545 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  21.93 
 
 		 556 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  25.2 
 
 		 535 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  21.45 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  22.11 
 
 		 581 aa  60.5  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  24.02 
 
 		 563 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  23.66 
 
 		 561 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  22.96 
 
 		 574 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  21.33 
 
 		 581 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  24.73 
 
 		 562 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  24.73 
 
 		 562 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  24.73 
 
 		 562 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  23.94 
 
 		 535 aa  57  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  21.81 
 
 		 563 aa  56.6  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  21.81 
 
 		 563 aa  56.6  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  22.64 
 
 		 581 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  20.56 
 
 		 584 aa  55.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  23.13 
 
 		 577 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  23.63 
 
 		 537 aa  54.3  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  27.19 
 
 		 229 aa  53.5  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  24.6 
 
 		 602 aa  53.5  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  23.74 
 
 		 537 aa  53.5  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  21.83 
 
 		 577 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5620  Terminase  23.59 
 
 		 537 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  21.4 
 
 		 568 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  21.53 
 
 		 556 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  19.26 
 
 		 590 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  19.26 
 
 		 590 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  19.26 
 
 		 590 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  25.5 
 
 		 215 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4116  phage terminase  26.42 
 
 		 555 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.72688 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0983  hypothetical protein  26.7 
 
 		 202 aa  47  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.597017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  26.77 
 
 		 581 aa  47  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  32 
 
 		 169 aa  46.6  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2607  phage terminase  25.11 
 
 		 558 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  26.91 
 
 		 604 aa  45.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  28.57 
 
 		 565 aa  44.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3612  Phage terminase-like protein protein large subunit-like protein  27.74 
 
 		 495 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395024  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  24.86 
 
 		 569 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>