93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4116 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II1044  phage terminase, large subunit, putative  63.83 
 
 		 580 aa  704    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176224  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2239  phage terminase  66.24 
 
 		 552 aa  736    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4116  phage terminase  100 
 
 		 555 aa  1135    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.72688 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3864  terminase  64.42 
 
 		 570 aa  715    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000385743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1538  putative phage terminase, large subunit  53.72 
 
 		 553 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0238  phage terminase  50.88 
 
 		 573 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3946  terminase  55.04 
 
 		 562 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.087061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2893  putative phage terminase, large subunit  53.54 
 
 		 553 aa  559  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134214 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2247  putative phage terminase, large subunit  53.54 
 
 		 553 aa  559  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000605357 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5068  Terminase  51.77 
 
 		 566 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4081  Terminase  51.6 
 
 		 566 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0938  putative phage terminase, large subunit  53.18 
 
 		 553 aa  553  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0646  phage terminase  47.48 
 
 		 578 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0135346  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1603  Terminase  43.68 
 
 		 557 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  43.58 
 
 		 569 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  43.4 
 
 		 569 aa  445  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1625  phage terminase  43.78 
 
 		 566 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000276041  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0988  phage terminase  39.16 
 
 		 573 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0359  phage terminase  39.16 
 
 		 573 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1750  phage terminase  36.81 
 
 		 570 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  24.63 
 
 		 541 aa  100  8e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  23.33 
 
 		 543 aa  94.7  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  22.2 
 
 		 545 aa  87.8  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  23.82 
 
 		 557 aa  87  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  22.67 
 
 		 546 aa  85.9  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  23.24 
 
 		 556 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  23.93 
 
 		 535 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  23.53 
 
 		 581 aa  80.1  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  21.82 
 
 		 564 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  21.91 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  22.22 
 
 		 563 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  22.22 
 
 		 563 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  22.97 
 
 		 540 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  21.91 
 
 		 573 aa  74.3  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  23.6 
 
 		 542 aa  73.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  23.26 
 
 		 552 aa  71.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  22.13 
 
 		 571 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  22.77 
 
 		 542 aa  70.5  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  23.98 
 
 		 521 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  21.02 
 
 		 581 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  25.58 
 
 		 498 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  22.24 
 
 		 574 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.19 
 
 		 591 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.19 
 
 		 562 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.19 
 
 		 590 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  21.32 
 
 		 577 aa  67.4  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  21.07 
 
 		 574 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  22.37 
 
 		 581 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  22.22 
 
 		 581 aa  64.7  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  21.22 
 
 		 570 aa  63.9  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  23.9 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  21.72 
 
 		 561 aa  62  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  21.97 
 
 		 581 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  21.27 
 
 		 568 aa  62  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  20.57 
 
 		 577 aa  61.6  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  22.14 
 
 		 537 aa  60.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  21.7 
 
 		 558 aa  60.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  21.85 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  22.18 
 
 		 535 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  22.14 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  21.64 
 
 		 585 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  22.16 
 
 		 562 aa  57.4  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  22.16 
 
 		 562 aa  57.4  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  23.18 
 
 		 602 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  22.35 
 
 		 565 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  22.93 
 
 		 586 aa  55.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  21.19 
 
 		 562 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  21.34 
 
 		 580 aa  54.7  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  21.19 
 
 		 562 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  20.24 
 
 		 562 aa  55.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  24.06 
 
 		 546 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  20.04 
 
 		 572 aa  54.3  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  21.24 
 
 		 556 aa  53.9  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  22.83 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  22.13 
 
 		 565 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  22.15 
 
 		 535 aa  51.2  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  21.97 
 
 		 550 aa  51.2  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  22.53 
 
 		 553 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  21.99 
 
 		 566 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  20.99 
 
 		 590 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  20.99 
 
 		 590 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  20.99 
 
 		 590 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  20.37 
 
 		 561 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  20.16 
 
 		 569 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  21.44 
 
 		 528 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  20.49 
 
 		 564 aa  47  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  21.53 
 
 		 535 aa  47  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3074  phage terminase  26.42 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  21.92 
 
 		 579 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  20.45 
 
 		 534 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  20.55 
 
 		 606 aa  44.3  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  24.76 
 
 		 581 aa  44.3  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  20.79 
 
 		 455 aa  44.3  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>