67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1044 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1044  phage terminase, large subunit, putative  100 
 
 
580 aa  1184    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176224  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2239  phage terminase  69.01 
 
 
552 aa  775    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3864  terminase  84.48 
 
 
570 aa  979    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000385743 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4116  phage terminase  63.83 
 
 
555 aa  705    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.72688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3946  terminase  57.34 
 
 
562 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.087061  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0238  phage terminase  51.99 
 
 
573 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1538  putative phage terminase, large subunit  55.16 
 
 
553 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2893  putative phage terminase, large subunit  54.98 
 
 
553 aa  571  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134214 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2247  putative phage terminase, large subunit  54.98 
 
 
553 aa  571  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000605357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0938  putative phage terminase, large subunit  54.98 
 
 
553 aa  568  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5068  Terminase  49.48 
 
 
566 aa  528  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4081  Terminase  49.66 
 
 
566 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0646  phage terminase  48.79 
 
 
578 aa  493  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0135346  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  43.21 
 
 
569 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  43.21 
 
 
569 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1603  Terminase  42.83 
 
 
557 aa  438  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1625  phage terminase  44.23 
 
 
566 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000276041  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0988  phage terminase  40.45 
 
 
573 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0359  phage terminase  40.28 
 
 
573 aa  381  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1750  phage terminase  39.43 
 
 
570 aa  362  9e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  24.43 
 
 
557 aa  72.8  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  23.19 
 
 
541 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  23.05 
 
 
540 aa  67.8  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  22.5 
 
 
545 aa  67  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  22.18 
 
 
561 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  21.36 
 
 
562 aa  63.9  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  21.36 
 
 
590 aa  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  21.44 
 
 
573 aa  63.5  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  25.33 
 
 
546 aa  63.5  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  22.78 
 
 
556 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  22.27 
 
 
543 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  24.37 
 
 
535 aa  61.6  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  21.18 
 
 
591 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  22.14 
 
 
571 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  21.54 
 
 
581 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  22.06 
 
 
530 aa  59.3  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  21.89 
 
 
581 aa  59.7  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  24.6 
 
 
521 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  25.12 
 
 
540 aa  54.3  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  21.14 
 
 
562 aa  53.9  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  21.14 
 
 
562 aa  53.9  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  21.25 
 
 
577 aa  53.5  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  23.51 
 
 
535 aa  53.5  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  20.99 
 
 
577 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  21.1 
 
 
574 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  25.5 
 
 
535 aa  51.2  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  24 
 
 
537 aa  50.8  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  22.76 
 
 
553 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  27.5 
 
 
586 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  22.71 
 
 
566 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  20.12 
 
 
563 aa  47.8  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  20.12 
 
 
563 aa  47.8  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  23.81 
 
 
590 aa  47.4  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  23.81 
 
 
590 aa  47.4  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  23.81 
 
 
590 aa  47.4  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  23.5 
 
 
537 aa  47.4  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  20.1 
 
 
542 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  23.53 
 
 
529 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  20.3 
 
 
542 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  22.2 
 
 
552 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  26.11 
 
 
491 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  23.02 
 
 
581 aa  45.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  23.38 
 
 
562 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  23.38 
 
 
562 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  22.63 
 
 
562 aa  44.3  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  23.05 
 
 
561 aa  44.3  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  22.38 
 
 
585 aa  43.9  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>