128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1302 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  100 
 
 
556 aa  1149    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  30.41 
 
 
581 aa  232  1e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  29.23 
 
 
564 aa  216  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  28.24 
 
 
556 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  28.04 
 
 
577 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  28.84 
 
 
585 aa  200  7e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  27.32 
 
 
577 aa  197  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  28.24 
 
 
573 aa  190  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  27.23 
 
 
565 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  26.02 
 
 
541 aa  179  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  27.9 
 
 
574 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  26.24 
 
 
569 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  27.13 
 
 
568 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  26.55 
 
 
565 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  28.05 
 
 
581 aa  173  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  25.89 
 
 
561 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  25.43 
 
 
543 aa  172  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  27.24 
 
 
565 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  25.88 
 
 
553 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  26.81 
 
 
566 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  24.62 
 
 
590 aa  163  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  24.62 
 
 
590 aa  163  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  24.62 
 
 
590 aa  163  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  27.8 
 
 
552 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  29.34 
 
 
534 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  26.76 
 
 
581 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  29.34 
 
 
534 aa  158  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  26.76 
 
 
584 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  27.57 
 
 
602 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  26.95 
 
 
581 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  25.9 
 
 
558 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  26.54 
 
 
581 aa  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  28.95 
 
 
535 aa  150  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  25.65 
 
 
546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  26.21 
 
 
586 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  25.96 
 
 
564 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  26.94 
 
 
561 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  26.35 
 
 
579 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  26.09 
 
 
550 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  28.44 
 
 
849 aa  144  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  26.33 
 
 
545 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  24.3 
 
 
563 aa  140  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  24.3 
 
 
563 aa  140  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  27.25 
 
 
521 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  25.21 
 
 
530 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  25.26 
 
 
574 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  25.22 
 
 
571 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  26.86 
 
 
535 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.29 
 
 
590 aa  134  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.29 
 
 
562 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.29 
 
 
591 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  26.81 
 
 
563 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  24.69 
 
 
581 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  25.66 
 
 
535 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  26.62 
 
 
583 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  25.29 
 
 
557 aa  130  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  24.85 
 
 
537 aa  130  9.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  21.77 
 
 
572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  24.85 
 
 
537 aa  128  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  26.22 
 
 
580 aa  127  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  28.53 
 
 
604 aa  127  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  26.05 
 
 
535 aa  126  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  28.03 
 
 
588 aa  125  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  27.49 
 
 
510 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  23.97 
 
 
542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  24.17 
 
 
542 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  23.42 
 
 
540 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  25.48 
 
 
455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  24.96 
 
 
629 aa  107  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  25.05 
 
 
562 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  25.05 
 
 
562 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  22.42 
 
 
569 aa  103  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  23.45 
 
 
540 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  29.81 
 
 
593 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  29.01 
 
 
606 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  23.55 
 
 
602 aa  96.7  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  28.64 
 
 
606 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  20.93 
 
 
561 aa  95.1  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  28.97 
 
 
611 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  22.34 
 
 
562 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  22.34 
 
 
562 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  26.45 
 
 
491 aa  90.5  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  23.8 
 
 
569 aa  90.1  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2023  phage terminase  22.42 
 
 
553 aa  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2059  phage terminase  22.42 
 
 
553 aa  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  24.48 
 
 
546 aa  88.6  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  23.06 
 
 
569 aa  88.2  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3592  terminase  21.9 
 
 
555 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2607  phage terminase  24.42 
 
 
558 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  21.68 
 
 
562 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  22.47 
 
 
570 aa  84.7  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  22.44 
 
 
555 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3946  terminase  24.27 
 
 
562 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.087061  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2239  phage terminase  23.74 
 
 
552 aa  82.4  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1376  putative phage terminase, large subunit  21.37 
 
 
555 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0389174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1603  Terminase  22.7 
 
 
557 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2702  putative phage terminase, large subunit  23.71 
 
 
551 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4081  Terminase  23.7 
 
 
566 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5068  Terminase  23.7 
 
 
566 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4116  phage terminase  23.24 
 
 
555 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.72688 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>