123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0670 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  100 
 
 
569 aa  1180    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  29.98 
 
 
566 aa  266  8e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  30.39 
 
 
581 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  29.8 
 
 
564 aa  262  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  28.96 
 
 
572 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  28.47 
 
 
565 aa  242  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  28.93 
 
 
571 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  28.14 
 
 
579 aa  237  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  27.76 
 
 
591 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.52 
 
 
590 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.52 
 
 
562 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1117  phage terminase  27.07 
 
 
629 aa  224  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  28.27 
 
 
590 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  28.27 
 
 
590 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  28.27 
 
 
590 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  27.64 
 
 
565 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  27.31 
 
 
553 aa  192  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  25.4 
 
 
573 aa  191  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1649  Phage terminase-like protein, large subunit  27.07 
 
 
626 aa  191  4e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  27.39 
 
 
541 aa  183  9.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  26.69 
 
 
585 aa  179  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  23.83 
 
 
561 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  23.83 
 
 
569 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  26.36 
 
 
586 aa  176  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  25.69 
 
 
552 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  25.38 
 
 
543 aa  172  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  26.74 
 
 
557 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  23.44 
 
 
556 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  25.35 
 
 
581 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  23.08 
 
 
564 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  26.13 
 
 
546 aa  168  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  23.81 
 
 
577 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  24.22 
 
 
577 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  23.65 
 
 
568 aa  161  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  24.63 
 
 
563 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  24.63 
 
 
563 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  25.09 
 
 
581 aa  159  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  23.39 
 
 
574 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  23.48 
 
 
581 aa  151  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  25 
 
 
565 aa  151  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  24.82 
 
 
558 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  24.38 
 
 
581 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  23.49 
 
 
629 aa  143  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  23.69 
 
 
530 aa  140  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  23.85 
 
 
602 aa  139  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  26.55 
 
 
588 aa  137  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  23.49 
 
 
581 aa  137  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  24.28 
 
 
550 aa  136  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  23.85 
 
 
561 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  24.21 
 
 
534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  23.65 
 
 
602 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  25.05 
 
 
498 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  24.87 
 
 
583 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  23.82 
 
 
534 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  23.63 
 
 
562 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  23.82 
 
 
535 aa  130  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  24.02 
 
 
562 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  24.02 
 
 
562 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  21.91 
 
 
574 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  22.54 
 
 
521 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  23.86 
 
 
606 aa  127  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  23.86 
 
 
606 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  25.65 
 
 
529 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  23.44 
 
 
535 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  22.45 
 
 
562 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  22.45 
 
 
562 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  22.26 
 
 
593 aa  121  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  24.58 
 
 
849 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  22.6 
 
 
535 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  23.56 
 
 
611 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  22.66 
 
 
604 aa  117  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  23.73 
 
 
563 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4976  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  25.15 
 
 
525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5356  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  25.15 
 
 
523 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  20.99 
 
 
537 aa  110  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  25.83 
 
 
570 aa  109  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  20.91 
 
 
537 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  22.04 
 
 
535 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  21.51 
 
 
542 aa  104  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  21.91 
 
 
542 aa  104  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2023  phage terminase  24.56 
 
 
553 aa  104  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2059  phage terminase  24.56 
 
 
553 aa  104  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  22.41 
 
 
540 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  21.84 
 
 
510 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  24.1 
 
 
491 aa  103  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2702  putative phage terminase, large subunit  24.18 
 
 
551 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  21.7 
 
 
545 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  21.37 
 
 
561 aa  100  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  22.44 
 
 
540 aa  95.9  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  22.42 
 
 
556 aa  94.7  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  22.47 
 
 
546 aa  88.2  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  22.88 
 
 
555 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  23.86 
 
 
528 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2607  phage terminase  24.07 
 
 
558 aa  83.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  22.14 
 
 
584 aa  83.2  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  22.04 
 
 
455 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  32.87 
 
 
163 aa  80.9  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  21.34 
 
 
555 aa  79  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  23.54 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  20.36 
 
 
580 aa  77  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>