123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2596 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  94.32 
 
 
581 aa  1146    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  57.8 
 
 
581 aa  659    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  72.39 
 
 
558 aa  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  100 
 
 
581 aa  1213    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  53.32 
 
 
602 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  52.12 
 
 
550 aa  553  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  47.77 
 
 
583 aa  528  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  48.01 
 
 
563 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  47.1 
 
 
588 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  48.42 
 
 
604 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  43.78 
 
 
602 aa  489  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  35.1 
 
 
593 aa  355  1e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  35.76 
 
 
606 aa  339  8e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  35.76 
 
 
606 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  33.99 
 
 
557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  36.32 
 
 
611 aa  326  7e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  36.19 
 
 
521 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  33.81 
 
 
552 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  34.36 
 
 
535 aa  292  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  31.14 
 
 
556 aa  289  9e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  33.51 
 
 
565 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  31.55 
 
 
581 aa  280  7e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  35.28 
 
 
534 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  35.09 
 
 
534 aa  274  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  32.88 
 
 
535 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  36.1 
 
 
849 aa  274  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  30.7 
 
 
564 aa  269  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  32.41 
 
 
585 aa  264  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  31.56 
 
 
568 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  28.65 
 
 
590 aa  246  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  28.65 
 
 
590 aa  246  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  28.65 
 
 
590 aa  246  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  31 
 
 
565 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  29.23 
 
 
553 aa  239  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  31.73 
 
 
546 aa  238  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  30.28 
 
 
541 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  28.87 
 
 
569 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  28.7 
 
 
561 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  29.46 
 
 
543 aa  226  8e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  30.84 
 
 
562 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  29.81 
 
 
580 aa  225  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  28.42 
 
 
574 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  30.84 
 
 
562 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  30.84 
 
 
562 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  29.57 
 
 
573 aa  224  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  27.89 
 
 
577 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  31.88 
 
 
498 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  30.59 
 
 
571 aa  223  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  28.87 
 
 
581 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  28.3 
 
 
577 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  28.47 
 
 
566 aa  219  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  30.13 
 
 
562 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  30.13 
 
 
562 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  27.21 
 
 
564 aa  217  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  27.48 
 
 
579 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.19 
 
 
590 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  27.93 
 
 
529 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.19 
 
 
562 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.19 
 
 
591 aa  209  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  29.78 
 
 
561 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  27.93 
 
 
574 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  26.97 
 
 
586 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  28.51 
 
 
572 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  27.37 
 
 
581 aa  194  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  29.08 
 
 
510 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  27.08 
 
 
528 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  26.77 
 
 
530 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  27.96 
 
 
563 aa  189  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  27.96 
 
 
563 aa  189  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  29.74 
 
 
491 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  28.21 
 
 
537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  27.35 
 
 
503 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  28.21 
 
 
537 aa  184  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  26.83 
 
 
565 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  27.07 
 
 
555 aa  180  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  26.98 
 
 
535 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  27.31 
 
 
546 aa  171  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  25.9 
 
 
542 aa  169  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  25.9 
 
 
545 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  27.59 
 
 
561 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  25.75 
 
 
540 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  25.52 
 
 
542 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  26.19 
 
 
535 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  25.41 
 
 
540 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  24.77 
 
 
584 aa  154  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  53.47 
 
 
163 aa  148  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  24.38 
 
 
569 aa  147  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  26.76 
 
 
556 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  23.98 
 
 
455 aa  133  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  28.77 
 
 
356 aa  123  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  32.74 
 
 
229 aa  118  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  22.3 
 
 
629 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  22.57 
 
 
534 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  22.39 
 
 
570 aa  107  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  32.84 
 
 
215 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1376  putative phage terminase, large subunit  21.53 
 
 
555 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0389174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3592  terminase  21.05 
 
 
555 aa  94.4  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  21.33 
 
 
555 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2153  phage terminase  24.9 
 
 
504 aa  89.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.503371  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2702  putative phage terminase, large subunit  20.72 
 
 
551 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>