117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1616 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  64.98 
 
 
602 aa  769    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  100 
 
 
563 aa  1160    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  56.96 
 
 
550 aa  603  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  50.54 
 
 
558 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  50.09 
 
 
581 aa  533  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  48.01 
 
 
581 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  48.08 
 
 
581 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  41.48 
 
 
588 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  39.76 
 
 
583 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  38.15 
 
 
602 aa  361  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  38.54 
 
 
604 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  35.83 
 
 
557 aa  329  6e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  32.75 
 
 
593 aa  290  6e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  33.09 
 
 
535 aa  281  3e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  33.27 
 
 
535 aa  281  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  35.33 
 
 
606 aa  281  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  35.15 
 
 
606 aa  277  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  33.21 
 
 
534 aa  276  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  34.49 
 
 
521 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  33.21 
 
 
534 aa  276  8e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  34.42 
 
 
611 aa  270  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  33.52 
 
 
552 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  32.84 
 
 
849 aa  259  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  32.72 
 
 
565 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  30.49 
 
 
581 aa  237  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  30.51 
 
 
556 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  28.42 
 
 
553 aa  217  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  28.34 
 
 
577 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  28.96 
 
 
564 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  25.51 
 
 
590 aa  212  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  25.51 
 
 
590 aa  212  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  28.17 
 
 
577 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  25.51 
 
 
590 aa  212  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  31.37 
 
 
498 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  29.78 
 
 
585 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  28.07 
 
 
569 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  28.97 
 
 
529 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  28.52 
 
 
574 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  27.7 
 
 
566 aa  203  8e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  26.91 
 
 
571 aa  203  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  27.71 
 
 
561 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  27.45 
 
 
530 aa  202  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  27.16 
 
 
564 aa  201  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  28.73 
 
 
581 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  27.67 
 
 
574 aa  193  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  26.81 
 
 
579 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  26.93 
 
 
580 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  28.9 
 
 
573 aa  191  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  30.84 
 
 
491 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  28.28 
 
 
562 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  28.28 
 
 
562 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.55 
 
 
562 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.55 
 
 
590 aa  189  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  26.73 
 
 
572 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  26.92 
 
 
561 aa  187  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  28.41 
 
 
503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  26.55 
 
 
543 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.37 
 
 
591 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  27.05 
 
 
541 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  27.51 
 
 
537 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  27.75 
 
 
562 aa  183  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  27.56 
 
 
562 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  27.56 
 
 
562 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  29.15 
 
 
546 aa  182  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  28.39 
 
 
568 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  28.31 
 
 
546 aa  181  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  26.94 
 
 
537 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  27.71 
 
 
563 aa  180  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  27.71 
 
 
563 aa  180  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  28.33 
 
 
510 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  28.37 
 
 
586 aa  177  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  28.28 
 
 
581 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  26.98 
 
 
528 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  26.61 
 
 
561 aa  170  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  28.54 
 
 
535 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  27.38 
 
 
535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  25.98 
 
 
565 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  25.28 
 
 
542 aa  161  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  25.09 
 
 
542 aa  158  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  27.12 
 
 
540 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  34.87 
 
 
229 aa  150  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  26.38 
 
 
540 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  24.01 
 
 
565 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  23.77 
 
 
584 aa  137  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  24.58 
 
 
545 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  55.28 
 
 
163 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  25 
 
 
455 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  26.81 
 
 
556 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  23.73 
 
 
569 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  26.08 
 
 
555 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  32.74 
 
 
169 aa  103  8e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  24.67 
 
 
356 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  21.83 
 
 
534 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  21.23 
 
 
570 aa  99.8  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  34.78 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  20.08 
 
 
555 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3592  terminase  20.28 
 
 
555 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1376  putative phage terminase, large subunit  20.04 
 
 
555 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0389174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2607  phage terminase  22.51 
 
 
558 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2633  phage terminase  24.44 
 
 
544 aa  68.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505963  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>